新一代测序中，基因从头测序和重测序有什么区别

基因从头测序也叫做基因de

novo测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱。

重测序是指在已知物种基因组的情况下，对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序，可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法，可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点（snp），插入缺失位点（indel，insertion

deletion），结构变异位点（sv，structure

variation），拷贝数变异（copy

number

variation，cnv）等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。

病毒变异率很高，一般不用重测序，可以用de

novo从头测序。

根据一级质谱可以测得多肽整体的分子量，多肽碎裂时会产生一系列在肽链不同位置断裂而形成的碎片离子，可以得到多肽的二级谱图，根据二级质谱相近谱峰之间的质量数之差可以推算出对应的氨基酸序列。

由两个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫做二肽，同理类推还有三肽、四肽、五肽等。通常由10~100个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫多肽。

扩展资料：

一般肽中含有的氨基酸的数目为二到九,根据肽中氨基酸的数量的不同,肽有多种不同的称呼：由两个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫做二肽，同理类推还有三肽、四肽、五肽等，一直到九肽。通常由10~100个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫多肽，它们的分子量低于10,000Da（Dalton，道尔顿），能透过半透膜，不被三氯乙酸及硫酸铵所沉淀。

也有文献把由2~10个氨基酸组成的肽称为寡肽（小分子肽）；10~50个氨基酸组成的肽称为多肽；由50个以上的氨基酸组成的肽就称为蛋白质，换言之，蛋白质有时也被称为多肽。多肽也简称为肽，是20世纪被发现的。

作题时你只用这样理解就行：

1酸水解 常用H2SO4或HCl进行水解。缺点色氨酸被完全分解，天冬酰胺和谷氨酰胺被变成天冬氨酸和谷氨酸。（蛋白质被水解为一个一个的氨基酸）

2碱水解 只有色氨酸稳定存在，其他都被水解。如果水解产物中有鸟氨酸或尿素，证明水解之前有精氨酸存在。（蛋白质被水解为一个一个的氨基酸）

3胰蛋白酶水解 只断裂赖氨酸或精氨酸残基的羧基参与形成的肽键。如果氨基酸序列按国际标准书写（即从N端到C端），那么这个酶水解Lys或Arg右边与下一个氨基酸连接的肽键。举例，画图表示，裂解位点为“|”，Asp-Lys-|-Gly。（蛋白质从断裂位点处断裂为多肽）

4糜蛋白酶水解 断裂Phe、Trp、Tyr疏水氨基酸残基的羧基端肽键。即断裂Phe、Trp、Tyr右边与下一个氨基酸连接的肽键。（蛋白质从断裂位点处断裂为多肽）

5嗜热菌蛋白酶水解 断裂Leu、Ile（异亮氨酸，看百度的这破字体都成什么了）、Phe、Trp、Val、Tyr或Met氨基酸残基的氨基端肽键。即断裂Leu、Ile、Phe、Trp、Val、Tyr或Met左边与上一个氨基酸连接的肽键。一般在题目中很少会出现这个酶，几乎不会考它，除非老师想故意为难你们。（蛋白质从断裂位点处断裂为多肽）

6胃蛋白酶水解 断裂两疏水性氨基酸（Phe、Leu、Trp、Tyr）之间的肽键。如Phe-Phe，Phe-Trp之间的肽键。一般考题中不会出这些特异性不强的水解酶。（蛋白质从断裂位点处断裂为多肽）

7溴化氰断裂 先声名，看清楚了，溴化氰的氰是哪个氰，不要看成氢气的氢！只断裂甲硫氨酸残基的羧基端肽键。（后面这句话知道知道就行了）断裂之后，甲硫氨酸变成肽酰高丝氨酸内酯。（蛋白质从断裂位点处断裂为多肽）

8羟胺（NH2OH）断裂 专一性断裂Asn-Gly之间的肽键。（蛋白质从断裂位点处断裂为多肽）

呵呵，大学考试会用到的也就这些了，这只是专为做题而总结的，其实上面那些酶或化学物质有些并不仅仅只水解我列举出来的那些位点，但在考试时一般不予与考虑。

华大基因背后的技术武器

　斥巨资采购128台基因测序仪，一举成为全球最大的基因测序中心，全额收购美国纳斯达克上市公司CompleteGenomics(下称CG)，改变中国生物科技企业被跨国企业单向并购的格局。华大基因向来不按套路出牌。看似有些疯狂的举动，实际是华大基因建立技术优势的精心布局。华大基因的服务规模和测序团队是全球最大的，但在测序技术平台上需购买大批设备和耗材。收购CG实现了资金技术的互补，也使技术优势成为打破原有国际基因市场格局的反击武器。

　大数据支撑科研新模式

　通常由于科学技术实现产业化的过程周期很长，但在生物科技领域，尤其是在21世纪以后，生命科学由原来经典的实验科学、作坊式的实验科学变成了工厂式大数据的大科学。这种大科学利用数据分析处理，大大缩短了从科学发现到产业化的过程，使得一家机构同时进行产学研一体化成为了可能。

　1990年由美、英、日、德、法及中国六国科学家启动的“国际人类基因组计划”，用10年时间、耗费30亿美元才完成了一个人的基因组测序。2007年华大基因只用半年，不到3000万人民币就完成了“第一个中国人基因图谱”。省时、高效的基因测序得益于华大基因在大数据背景下开创的新型基因科研模式，华大基因打造了具有全球竞争力的综合性大平台。在强大“平台体系”驱动下，围绕生命中心法则，建起了测序、质谱、生物计算和国家基因库综合技术平台。

　测序平台承载着基因测序产业的重任，它使人类进一步解读生命奥妙成为了可能。华大基因测序平台主要以高通量测序平台为主，此外，还包括了罗氏454测序平台及Ion Torrent测序平台。测序涉及生物学各领域，包括DNA测序、RNA测序、宏基因组测序、甲基化测序、外显子捕获测序等。此外，还有合成平台、基因分型平台、全基因酶切图谱平台等让测序结果更精确的辅助平台。

　质谱平台基于高通量质谱技术进行工业规模的'蛋白质组学、代谢组学研究及目标分子检测，主要进行蛋白质组学和代谢组学的全谱分析、定量分析、蛋白修饰分析以及目标蛋白、多肽和各种小分子的分析检测，也可以结合基因组、转录组数据展开贯穿性科研项目。

　信息中心以实现超大规模生物信息学计算为中心任务，不断提升其在高效能计算、云计算服务能力，为海量数据处理提供创新解决方案。华大基因拥有深圳、香港、北京、武汉、杭州等数个大型生物信息学超级计算中心，总峰值计算能力达到212 T flops， 总内存容量达到359 TB，总存储能力达到1838 PB。其位于深圳和香港的集群的峰值计算能力分列国内生物信息领域第一和第二位，有能力为海量生物信息学数据的存储、处理和分析提供稳定而高效的资源保障。

　国家基因库集生物资源样本库、生物信息数据库和生物资源信息网络为一体，通过建立高水平的生物资源样本库、高效的生物信息数据处理、存储与管理系统以及覆盖广泛的联盟网络，有效保护、合理开发和利用我国生物资源及基因数据资源，充分调动、发挥及整合各地区、各单位的资源和技术优势，积极开展广泛交流与合作。

　竞争王牌：测序技术革新

　2013年3月18日，华大基因宣布完成对CG的全额收购。华大在并购完成之后，保留了CG在硅谷的研发团队，并将团队规模扩大了一倍，同时结合中国本土的经验丰富的研发团队共同合作，开发出将投入产业化应用的临床测序技术BGISEQ-1000和BGISEQ-100。新产品大大简化了样品处理的流程，缩短了整个周期，优化了生物云平台，做到一键式、傻瓜式、大数据库支持，能够进入任何一家医院而不需要任何前期测序基础。在临床产品的精度、可重现性和稳定性方面比市面已有技术提高几个数量级，达到99999%以上的碱基准确性。

　华大的测序技术采取的原理各有不同，其中代表性的有基于焦磷酸化学发光的454测序技术、基于连接反应的边连接边测序技术SBL、基于锚定探针连接的CPAL技术、基于可逆终止边合成边连接技术(SBS)和测序过程中基于氢质子浓度变化的半导体检测技术。

　华大测序的特点主要是序列短(30—150bp)、但是检测通量大(从开始的几百Mb到目前的1Tb以上的通量)、检测周期灵活(几个小时到几天)。正是因为通量高，所以测序的价格已经是第一代测序的万分之一，甚至更低。最早做一个人类基因组测序需要30亿美元，现在测序成本只需要1000美元。

　如今，华大基因在基因测序领域保持着领先的技术优势，包括效率高、成本低的高通量测序;准确率高的高深度测序;全球领先的基因组组装软件，自主研发的SOAPdenovo软件;而且有着丰富的经验，华大基因已经成功完成几百个物种的全基因组从头测序。

　产业化新起点

　如今，华大基因已经进入到产业化的新阶段，除了传统的科技合作项目之外，个人基因检测服务于医疗领域，成为了华大基因发展的新起点。

　全世界每年约有500万缺陷儿出生，给这些家庭造成了巨大的精神和经济负担。产前筛查、产前诊断是防治出生缺陷的重要方法之一，但是目前的方法都无法达到既精准又安全无创。近年来随着高通量测序技术的发展，DNA测序成本降低，一项新的产前检测技术——无创产前基因检测技术应运而生。华大基因在自身高通量测序平台的基础上，于2010年末推出了产前基因检测服务，只需通过采集孕妇外周血，提取血浆中的游离DNA，就可利用测序方法分析胎儿患染色体非整倍性疾病的风险率。目前，除无创产前基因检测技术外尚有针对染色体病、单基因病的众多项目在研发过程中。

　目前全球基因测序领域处于一个快速向应用转化的产业化、民用化发展阶段。整个基因测序市场中从业公司的估值也都将随着产业的爆发而水涨船高，该领域前景将继续受到投资者和资本市场的广泛关注。

　基因科技，这个揭示人类生命奥秘的学科，未来必将孕育出全世界最大、最重要的产业市场。

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