香菇菌丝由孢子萌发而成，菌丝白色，生长方向同斜面培养基平行，并向两侧试管壁伸长许多，呈树枝状，后期还有少量褐色薄膜在上面。
香菇的子实体是群生或丛生。菌盖半肉质，宽5~20厘米，初期扁半球形，后来渐渐平展，有时中部稍下凹，黄色至深肉桂色，上有鳞片，有时有菊花状或龟甲状裂纹。
香菇幼小时，菌盖边缘与菌柄间有深褐色绒毛状的菌幕联结。菌盖开展后，部分菌幕残余物附着于菌盖边缘。菌环以下部分往往覆有鳞片，菌环窄且易消失。
菌肉厚，中部可达1厘米左右，白色。菌褶白色，刀片状，稠密而柔软，宽3~4毫米，弯生。菌柄中生至偏生，白色，内实，纤维质，常弯曲，长3~6厘米，粗0.5~1厘米。菌褶表面被以子实层，上面有许多担子和隔丝。这种担子有4个担子梗，每个梗上着生1枚孢子，4枚孢子中“+”“-”各两个。孢子印白色，孢子无色，椭圆形，（4.5~5）×（2~2.5）微米。
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