receipt 英音:[ri'si:t]美音:[rɪ'sit]
名词 n
1收到,接到[U]
We are awaiting the receipt of further information
我们正等待接获进一步的消息。
2收据,收条[C]
I paid the bill but he neglected to give me a receipt
我付了帐单,但他忘了给我收据。
3收到的物(或款项);收入[P]
Box-office receipts amounted to over a million
票房收入超过了一百万。
及物动词 vt
1主美出具的收据;承认收到
2在上注明收讫字样
Pay the bill and ask the grocer to receipt it
付帐之后请食品杂货商注明收讫。
表观遗传学,包括组蛋白共价修饰(covalent histone modification)、DNA甲基化修饰(DNA methylation)、RNA甲基化修饰(RNA methylation)、基因组印记(genomic imprinting)、基因沉默(gene silencing)、RNA编辑(RNA editing)及非编码RNA(noncoding RNA)等,是 指在核苷酸序列不发生改变的情况下,生物表型或基因表达发生了稳定的可遗传变化 。
RNA甲基化 作为表观遗传学研究的重要内容之一,是指发生在RNA分子上不同位置的甲基化修饰现象, 6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A) 和 5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C) 是真核生物中最常见的两种RNA转录后修饰。RNA甲基化在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解等方面可能扮演重要角色。 相对于DNA甲基化,RNA甲基化更加复杂、种类繁多、普遍存在于各种高级生物中。
已知绝大部分真核生物中,mRNA在5’ Cap处存在甲基化修饰,作用包括维持mRNA稳定性、 mRNA前体剪切、多腺苷酸化、 mRNA运输与翻译起始等。而3’ polyA发生的修饰有助于出核转运、翻译起始以及与polyA结合蛋白⼀起维持mRNA的结构稳定。但是这些修饰只发生mRNA的头部和尾部,关于RNA的内部修饰(internal modification)在许多种类的RNA中都有发⽣。无论是mRNA还是lncRNA,都大量存在m6A修饰。m6A能够加速mRNA前体的加工时间,加快mRNA在细胞中的转运速度和出核速度。主要学习研究较多的m6A。RNA的m6A甲基化⼀共有大三类酶参与: Writers、 Erasers和Readers ,需要相关研究的可以学习相关文献。
检测m6A的方法非常多,如包括MeRIPseq、 miCLIP-seq、 SCARLET、 LC-MS/MS等。2012年之后,两篇发表于Nature和Cell上的论⽂可以说是第⼀次从转录水平上,大范围高通量地鉴定了人和小鼠m6A的甲基化水平(Dominissini 2012和Meyer 2012)。这两篇独立发表的论文采用的 核心方法就是 将m6A抗体与带有m6A的mRNA片段相结合 后进行高通量测序 。通过对下机数据的分析,来鉴定mRNA上m6A程度较高的区域,分辨率约为100nt。这种方法我们称之为MeRIP-seq( me thylated R NA i mmuno p recipitation sequencing)或m6A-seq。
MeRIP-seq建库步骤 :
1 提取total RNAs,并用Oligo-dT磁珠对total RNAs带有polyA的mRNA进行富集(通常要求Total RNA 300ug,人鼠可以做微量2ug 但结果可能会出现map率低dup率高 建库步骤与常量也有区别);
2 用磁珠进行富集,得到带有polyA的mRNA。之后加入片段化试剂,将完整的mRNA进行片段化。或者使用超声波仪直接进行片段化;
3 将片段化后的RNA分成两份。⼀份加入带有m6A抗体的免疫磁珠,对含有m6A甲基化的mRNA片段进⾏富集。另⼀份作为control,直接构建类似常规的转录组测序文库(这一步就是IP步骤,片段化程度、抗体抓取效率都会影响到后期实验结果;这里的control通常称为Input);
4 对m6A抗体免疫磁珠进行富集,带有m6A的mRNA片段进行回收后,按照转录组的建库流程构建常规的测序文库;
5 分别将构建好的2个测序文库,即m6A-seq library和RNA-seq library分别进行高通量测序。测序平台保持一致,推荐Hiseq X ten或Novaseq;
6 对下机数据进行生物信息学分析,对发生m6A甲基化程度较高的区域进行peak calling。由于不能做到单个碱基的分辨率,所以只能对大致的区域进行分析。从下图中我们可以发现,与右侧常规的转录组测序结果相比,在基因上有两处区域存在非常明显的高甲基化峰;
7接下来会进行一些常规分析,如peak区域基因注释,差异peak分析。
以上就是关于m6A-seq的标准步骤,现在是不是对m6A-seq有了一个非常直观的认识呢? 再次强调下,这种测序方法只能鉴定高甲基化的区域,并不能做到单碱基的分辨率。
思路1 老数据挖掘
第一步:先从原有的转录组数据中,挖掘到差异表达的甲基化酶;
第二步:对挖掘到的甲基化酶如METTL3或FTO等进⾏qPCR验证,并进行m6A-seq分析哪些基因甲基化水平发生改变;
第三步:在细胞(动物模型可选)中对这些酶进行敲低和过表达,进行常规的qPCR和WB检测相关酶表达情况,并用LC-MS/MS法检测RNA整体m6A水平;
第四步:继续对这些敲低和过表达的细胞进行转录组测序/小RNA测序或表达谱芯片/小RNA芯片,分析哪些基因出现差异表达变化和可变剪切变化;
第五步:找到甲基化酶调控的靶基因,进行敲低和过表达,看甲基化酶缺陷的细胞或动物模型表型能否补救;
第六步:在确定上一步靶基因确实受到甲基化酶调控后,对靶基因上的motif进行点突变后进行验证;
第七步:鉴定新型的甲基化酶(可选)。
思路2 研究甲基化修饰差异基因
第一步:直接进行m6A-seq和转录组测序,找到时间顺序或差异表达的基因并用qPCR、 WB等⽅法验证,此外找到m6A有差异的基因;
第二步:对甲基化酶进行敲低和过表达,检测RNA整体的m6A水平,之后可进行转录组或小RNA测序等方法检验甲基化酶敲低和过表达对mRNA或miRNA整体的影响,并着重研究第⼀步中感兴趣的m6A有差异的靶基因;
第三步:对靶基因进行敲低或过表达,是否能够对甲基化酶异常表达后的表型进⾏恢复;
第四步:对靶基因上motif进行点突变后进⼀步确认直接受到甲基化酶调控;
第五步:鉴定新型的甲基化酶(可选)。
当然根据不同的研究目的还有许多其他的研究思路,可根据自身实验设计进行延申和拓展。m6A相关SCI论文根据不同实验手段IF2~20不等,实验手段:m6A-seq、转录组测序/表达谱芯片、 LC-MS/MS 或 m6A 比色法、小RNA 测序/小RNA芯片、qPCR、 WB、敲降/过表达、靶基因验证、动物实验、临床实验/药物实验等。
学习资源来源网络,侵删。
参考学习:
1、 高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展
2、 RNA修饰检测技术
Roundtree, Ian A et al “Dynamic RNA Modifications in Gene Expression Regulation” Cell vol 169,7 (2017): 1187-1200 doi:101016/jcell201705045
Helm, M, & Y Motorin "Detecting RNA modifications in the epitranscriptome: predict and validate” Nature Reviews Genetics 185 (2017):275
表观遗传学,包括组蛋白共价修饰(covalent histone modification)、DNA甲基化修饰(DNA methylation)、RNA甲基化修饰(RNA methylation)、基因组印记(genomic imprinting)、基因沉默(gene silencing)、RNA编辑(RNA editing)及非编码RNA(noncoding RNA)等,是 指在核苷酸序列不发生改变的情况下,生物表型或基因表达发生了稳定的可遗传变化 。
RNA甲基化 作为表观遗传学研究的重要内容之一,是指发生在RNA分子上不同位置的甲基化修饰现象, 6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A) 和 5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C) 是真核生物中最常见的两种RNA转录后修饰。RNA甲基化在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解等方面可能扮演重要角色。 相对于DNA甲基化,RNA甲基化更加复杂、种类繁多、普遍存在于各种高级生物中。
已知绝大部分真核生物中,mRNA在5’ Cap处存在甲基化修饰,作用包括维持mRNA稳定性、 mRNA前体剪切、多腺苷酸化、 mRNA运输与翻译起始等。而3’ polyA发生的修饰有助于出核转运、翻译起始以及与polyA结合蛋白⼀起维持mRNA的结构稳定。但是这些修饰只发生mRNA的头部和尾部,关于RNA的内部修饰(internal modification)在许多种类的RNA中都有发⽣。无论是mRNA还是lncRNA,都大量存在m6A修饰。m6A能够加速mRNA前体的加工时间,加快mRNA在细胞中的转运速度和出核速度。主要学习研究较多的m6A。RNA的m6A甲基化⼀共有大三类酶参与: Writers、 Erasers和Readers ,需要相关研究的可以学习相关文献。
检测m6A的方法非常多,如包括MeRIPseq、 miCLIP-seq、 SCARLET、 LC-MS/MS等。2012年之后,两篇发表于Nature和Cell上的论⽂可以说是第⼀次从转录水平上,大范围高通量地鉴定了人和小鼠m6A的甲基化水平(Dominissini 2012和Meyer 2012)。这两篇独立发表的论文采用的 核心方法就是<u style="box-sizing: border-box; user-select: text !important;">将m6A抗体与带有m6A的mRNA片段相结合</u>后进行高通量测序 。通过对下机数据的分析,来鉴定mRNA上m6A程度较高的区域,分辨率约为100nt。这种方法我们称之为MeRIP-seq( me thylated R NA i mmuno p recipitation sequencing)或m6A-seq。
MeRIP-seq建库步骤 :
1 提取total RNAs,并用Oligo-dT磁珠对total RNAs带有polyA的mRNA进行富集(通常要求Total RNA 300ug,人鼠可以做微量2ug 但结果可能会出现map率低dup率高 建库步骤与常量也有区别);
2 用磁珠进行富集,得到带有polyA的mRNA。之后加入片段化试剂,将完整的mRNA进行片段化。或者使用超声波仪直接进行片段化;
3 将片段化后的RNA分成两份。⼀份加入带有m6A抗体的免疫磁珠,对含有m6A甲基化的mRNA片段进⾏富集。另⼀份作为control,直接构建类似常规的转录组测序文库(这一步就是IP步骤,片段化程度、抗体抓取效率都会影响到后期实验结果;这里的control通常称为Input);
4 对m6A抗体免疫磁珠进行富集,带有m6A的mRNA片段进行回收后,按照转录组的建库流程构建常规的测序文库;
5 分别将构建好的2个测序文库,即m6A-seq library和RNA-seq library分别进行高通量测序。测序平台保持一致,推荐Hiseq X ten或Novaseq;
6 对下机数据进行生物信息学分析,对发生m6A甲基化程度较高的区域进行peak calling。由于不能做到单个碱基的分辨率,所以只能对大致的区域进行分析。从下图中我们可以发现,与右侧常规的转录组测序结果相比,在基因上有两处区域存在非常明显的高甲基化峰;
7接下来会进行一些常规分析,如peak区域基因注释,差异peak分析。
以上就是关于m6A-seq的标准步骤,现在是不是对m6A-seq有了一个非常直观的认识呢? 再次强调下,这种测序方法只能鉴定高甲基化的区域,并不能做到单碱基的分辨率。
思路1 老数据挖掘
第一步:先从原有的转录组数据中,挖掘到差异表达的甲基化酶;
第二步:对挖掘到的甲基化酶如METTL3或FTO等进⾏qPCR验证,并进行m6A-seq分析哪些基因甲基化水平发生改变;
第三步:在细胞(动物模型可选)中对这些酶进行敲低和过表达,进行常规的qPCR和WB检测相关酶表达情况,并用LC-MS/MS法检测RNA整体m6A水平;
第四步:继续对这些敲低和过表达的细胞进行转录组测序/小RNA测序或表达谱芯片/小RNA芯片,分析哪些基因出现差异表达变化和可变剪切变化;
第五步:找到甲基化酶调控的靶基因,进行敲低和过表达,看甲基化酶缺陷的细胞或动物模型表型能否补救;
第六步:在确定上一步靶基因确实受到甲基化酶调控后,对靶基因上的motif进行点突变后进行验证;
第七步:鉴定新型的甲基化酶(可选)。
思路2 研究甲基化修饰差异基因
第一步:直接进行m6A-seq和转录组测序,找到时间顺序或差异表达的基因并用qPCR、 WB等⽅法验证,此外找到m6A有差异的基因;
第二步:对甲基化酶进行敲低和过表达,检测RNA整体的m6A水平,之后可进行转录组或小RNA测序等方法检验甲基化酶敲低和过表达对mRNA或miRNA整体的影响,并着重研究第⼀步中感兴趣的m6A有差异的靶基因;
第三步:对靶基因进行敲低或过表达,是否能够对甲基化酶异常表达后的表型进⾏恢复;
第四步:对靶基因上motif进行点突变后进⼀步确认直接受到甲基化酶调控;
第五步:鉴定新型的甲基化酶(可选)。
当然根据不同的研究目的还有许多其他的研究思路,可根据自身实验设计进行延申和拓展。m6A相关SCI论文根据不同实验手段IF2~20不等,实验手段:m6A-seq、转录组测序/表达谱芯片、 LC-MS/MS 或 m6A 比色法、小RNA 测序/小RNA芯片、qPCR、 WB、敲降/过表达、靶基因验证、动物实验、临床实验/药物实验等。
翠玉录》(Emerald Tablet)是关于炼金术最早的记载,也是炼金术重要的文献之一
公元前1900年,埃及法老赫耳墨斯以及他传说中的父亲透特神(Toth)以及赫尔墨斯的大儿子大祭祀塔特(Tat)三人合为一体,成为人们传说中的“赫尔墨斯神“。这三位一体的神将炼金术的知识浓缩为13句话,雕刻在一块祖母绿宝石板上,这就是闻名于世的翠玉录
翠玉录内容:
1 当我走进洞穴,我看到了一块翠玉,上面写着字,那是从赫尔墨斯的双手间被书写出来。从那里我发现了以下这些文字:
When I entered into the cave,I received the tablet zaradi,which was inscribed,from between the hands of Hermes,in which I discovered these word:
2 真实不虚,永不说谎,必然带来真实:
This true without lying, certain & most true:
3 下如同上,上如同下;依此成全太一的奇迹。
That which is below is like that which is above and that which is above is like that which is below to do ye miracles of one only thing
4 万物本是太一,藉由分化从太一创造出来。
And as all things have been and arose from one by ye mediation of one: so all things have their birth from this one thing by adaptation
5 太阳为父,月亮为母,从风孕育,从地养护。
The Sun is its father, the moon its mother, the wind hath carried it in its belly, the earth its nourse
6 世间一切完美之源就在此处;其能力在地上最为完全。
The father of all perfection in ye whole world is here Its force or power is entire if it be converted into earth
7 分土于火,萃精于糙,谨慎行之。
Separate thou ye earth from ye fire, ye subtile from the gross sweetly wth great indoustry
8 从地升天,又从天而降,获得其上、其下之能力。
It ascends from ye earth to ye heaven & again it desends to ye earth and receives ye force of things superior & inferior
9 如此可得世界的荣耀、远离黑暗蒙昧。
By this means you shall have ye glory of ye whole world & thereby all obscurity shall fly from you
10 此为万力之力,摧坚拔韧。
Its force is above all force, for it vanquishes every subtile thing & penetrates every solid thing
11世界即如此创造,依此可达奇迹。
So was ye world created From this are & do come admirable adaptations whereof ye process is here in this
12我被称为三重伟大的赫尔墨斯,因我拥有世界三部分的智慧。
Hence I am called Hermes Trismegist, having the three parts of ye philosophy of ye whole world
13这就是我所说的伟大工作。
That which I have said of ye operation of ye Sun is accomplished & ended
I added you Micro message, you receive
微信 (WeChat)[1] 是腾讯公司于2011年1月21日推出的一个为智能终端提供即时通讯服务的免费应用程序[1] ,由张小龙所带领的腾讯广州研发中心产品团队打造 [2] 。微信支持跨通信运营商、跨操作系统平台通过网络快速发送免费(需消耗少量网络流量)语音短信、视频、和文字,同时,也可以使用通过共享流媒体内容的资料和基于位置的社交插件“摇一摇”、“漂流瓶”、“朋友圈”、”公众平台“、”语音记事本“等服务插件。
截止到2016年第二季度,微信已经覆盖中国 94% 以上的智能手机,月活跃用户达到 806亿,[3] 用户覆盖 200 多个国家、超过 20 种语言。[4] 此外,各品牌的微信公众账号总数已经超过 800 万个,移动应用对接数量超过 85000 个,广告收入增至3679亿人民币[3] ,微信支付用户则达到了 4 亿左右。[4]
微信提供公众平台、朋友圈、消息推送等功能,用户可以通过“摇一摇”、“搜索号码”、“附近的人”、扫二维码方式添加好友和关注公众平台,同时微信将内容分享给好友以及将用户看到的精彩内容分享到微信朋友圈。
2016年3月1日起,微信支付对转账功能停止收取手续费。同日起,对提现功能开始收取手续费。[5] 3月10日,微信官方首次公布“企业微信”的相关细节,并于4月18日通过应用宝正式发布安卓版。8月,微信与支付宝同获香港首批支付牌照[6] 。
2017年12月25日,“微信身份证网上应用凭证”在广州市南沙区签发,为线上、线下政务服务以及旅馆业登记、物流寄递等实名制应用场景,提供国家法定证件级身份认证服务。
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