莫布里连得6分开始第三节,骑士队追近比分。霍勒迪回应三分,韦德三分命中,骑士队以45-50落后。杜阿尔特连投带罚得到4分稳住局势,之后的比赛两队交替得分,史蒂文斯替补出场连续两次跑投命中,骑士队以61-65落后。杜阿尔特手感火热,弧顶投中三分,三节结束时步行者队以68-61领先。杜阿尔特单节得到12分。
凝血因子是参与血液凝固过程的各种蛋白质组分。它的生理作用是,在血管出血时被激活,和血小板粘连在一起并且补塞血管上的漏口。这个过程被称为凝血。整个凝血过程大致上可分为两个阶段,凝血酶原的激活及凝胶状纤维蛋白的形成。它们部分由肝生成。可以为香豆素所抑制。为统一命名,世界卫生组织按其被发现的先后次序用罗马数字编号, 有凝血因子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ,Ⅶ,Ⅷ,Ⅸ,Ⅹ,Ⅺ,Ⅻ,Xlll等,因子XIII以后被发现的凝血因子,经过多年验证,认为对于凝血功能,无决定性的影响,不再列入凝血因子的编号。因子 VI 事实上是活化的第五因子,已经取消因子VI的命名。
基本介绍 中文名 :凝血因子 外文名 :blood coagulation factor 类型 :蛋白质组分 命名方 :世界卫生组织 生理作用 :补塞血管上的漏口 主要凝血因子,辅助凝血因子,共同凝血,列举,临床套用,凝血酶原激活,纤维蛋白形成,相关疾病, 主要凝血因子 因子I,纤维蛋白原 因子II,凝血酶原(凝血素) 因子III,组织因子(凝血酶原酶) 因子IV,钙因子(Ca2+) 因子V,促凝血球蛋白原,易变因子 因子VII,转变加速因子前体,促凝血酶原激酶原,辅助促凝血酶原激酶 因子VIII,抗血友病球蛋白A(AHG A),抗血友病因子A(AHF A),血小板辅助因子I,血友病因子VIII或A 因子IX,抗血友病球蛋白B(AHG B),抗血友病因子B(AHF B),血友病因子IX或B 因子X,STUART(-PROWER)-F,自体凝血酶原C 因子XI,ROSENTHAL因子,抗血友病球蛋白C 因子XII,HAGEMAN因子,表面因子 因子XIII,血纤维稳定因子 辅助凝血因子 共同凝血 FITZGERALD因子 FLETCHER因子(激肽释放酶原) von-Willebrand-因子 被取消资格的凝血因子 因子VI,促凝血球蛋白:其实是活化后的第五因子。 这些因子共同作用,会导致凝血。 如果一种或多种凝血因子缺失,会导致血友病。 列举 同义语 缩写符号 血浆浓度 在血清中 贮存稳定性 参与凝血途径 Ⅰ 纤维蛋白原 Fg 2000-4000 无 稳定 共同 Ⅱ 凝血酶原 200 有10%-12% 稳定 共同 Ⅲ 组织凝血激酶TF 外源 Ⅴ 前加速素 5-10 无 不稳定 共同 Ⅶ 前转变素 2 有 稳定 外源 Ⅷ 抗血友病因子 AHG 〈10 无 不稳定 内源 Ⅸ 血浆凝血激酶PTC 3-4 有 较稳定 内源 Ⅹ Stuart Power因子 6-8 有 稳定 共同 Ⅺ 血浆凝血激酶前质 PTA 4 有 稳定 内源 Ⅻ 接解因子 HF 29 有 稳定 内源 PK 激肽释放酶原 PK 15-50 有 稳定 内源 HMWK 高分子量激肽原 HMWK 7 有 稳定 内源 ⅩⅢ 纤维蛋白稳定因子 FSF 25 无 稳定 共同 临床套用 PT延长 通常认为PT延长代表凝血因子Ⅱ、Ⅴ、Ⅶ、Ⅹ的活性低于正常或抗凝物质的存在。肝功能轻度受损,PT仍可正常,它仅在肝实质细胞严重损害时才明显延长。仅以PT判断肝病患者凝血功能异常和肝细胞损伤程度是不够的,如同时测定凝血因子的活性,可能更有价值。 肝病与凝血因子Ⅱ 大多数研究认为急性肝炎和慢性肝炎轻度患者,凝血因子Ⅱ活性正常或轻度下降;慢性肝炎中度、重度和肝硬化患者,凝血因子Ⅱ活性水平明显下降,说明它的降低程度与肝细胞损害程度密切相关。有研究认为异常凝血酶原(protein-Ⅱinduced by vitamin Kabsence,PIVKA-Ⅱ)可用于原发性肝癌的诊断,部分AFP阴性的原发性肝癌患者PIVKA-Ⅱ阳性,还有研究认为小肝癌患者PIVKA-Ⅱ阳性率高于AFP,它还有助于原发性肝癌的病情变化及疗效判断,在临床上应联合检测AFP与PIVKA-Ⅱ。 凝血因子Ⅴ 研究显示凝血因子Ⅴ活性在肝功能失代偿或严重肝病时才减少,故认为它是判断肝病患者预后的良好指标。Izumi等研究显示:对乙酰氨基酚诱导的需肝移植的暴发性肝功能衰竭患者,凝血因子Ⅴ活性<20%时对死亡的阳性预测值为049, 凝血因子 <10%时为057;而其它原因诱导的需肝移植的暴发性肝功能衰竭患者,凝血因子Ⅴ活性<20%时对死亡的阳性预测值为085,<10%时为100,因此认为凝血因子Ⅴ活性是判断非对乙酰氨基酚诱导的暴发性肝功能衰竭患者预后的最佳预测指标。邹正升等研究认为凝血因子Ⅴ水平比PTA更特异的反映重型肝炎患者的预后,两者联合可能有助于更早更准确诊断重型肝炎,同时指出应加强重型肝炎因子Ⅴ的检测及重视因子Ⅴ在作为肝衰竭患者行肝移植术时的主要筛选指标的研究。凝血因子Ⅴ活性除用于判断预后外,还与血栓的形成密切相关,可作为门静脉血栓形成的预测指标。 凝血因子Ⅶ 凝血因子Ⅶ的半衰期最短(4~6h),血浆含量较低(05~2mg/L),故可作为肝病患者蛋白质合成功能减退的早期诊断指标。Rodriguez-Inigo等在慢性肝病患者通过肝活检组织原位杂交的方法检测到凝血因子Ⅶ的表达与肝纤维化的分级呈负相关,可作为预测纤维化程度的指标。凝血因子Ⅶ活性还与预后有着密切的联系,如Violi等研究认为凝血因子Ⅶ活性<34%的肝硬化患者93%在随访10月内死亡,故认为它是肝硬化患者预后好坏的早期预测指标,可更好识别肝移植候选人。肝硬化患者凝血因子Ⅶ活性可明显下降,凝血因子Ⅶ缺乏可导致血小板活性的改变,结合血小板计数减少使出血时间延长,因此对有创诊断与治疗的肝硬化患者,还应该用凝血因子Ⅶ活性进行出血危险度的评估,而不能仅看血小板计数。除诊断之外,重组凝血因子Ⅶ可以有效地纠正肝病患者凝血异常,有利于有创性检查的进行。 凝血因子Ⅷ 凝血因子Ⅷ不仅由肝细胞产生,而且由窦内皮细胞与库普弗细胞产生,其它组织如肾脏也可产生。当肝细胞合成功能减退时,窦内皮细胞及库普弗细胞仍维持凝血因子Ⅷ的合成;肝脏清除功能减退,内毒素及免疫因素 使它的合成与释放增加。范威氏因子(von willebrand factor,vWF)主要由肝外合成,肝硬化患者可能由于内毒素血症,血管内皮细胞功能异常,使其释放增加;vWF分解蛋白酶对其分解减少,也使其血浆水平升高。在大多数病毒性肝炎患者凝血因子Ⅷ活性、vWF均明显升高。但肝病合并DIC者,由于凝血因子大量消耗,使凝血因子Ⅷ活性水平降低,故中国将凝血因子Ⅷ活性小于正常50%作为诊断肝病合并DIC的必备条件之一。 参与血液凝固过程的各种组分;其中大多是含糖的丝氨酸蛋白酶。整个凝血过程大致上可分为两个阶段,凝血酶原的激活及凝胶状纤维蛋白的形成。 凝血酶原激活 激活系统 体记忆体在有内源性及外源性两种激活系统。前者是指心血管内膜受损,或血液流出体外通过与异常表面接触而激活因子Ⅻ(Hageman factor)。后者则由于组织损伤释放出因子Ⅲ,从而激活因子Ⅶ。两者都能启动一系列连锁反应,并在因子Ⅹ处汇合,最后都导致凝血酶原的激活及纤维蛋白的形成。 激活 内源性激活系统 整个凝血酶的激活途径如图2所示。当血液与带负电荷的胶原蛋白(皮肤血管外壁)或异体表面(如高岭土、玻璃等)接触时,因子Ⅻ就由酶原激活成Ⅻa,后者除能激括因子Ⅺ外,又同时使血浆前舒缓激肽释放酶激活。激活后的激肽释放酶在高分子量激肽原的促进下反过来又进一步使因子Ⅻ激活,但此时不再是接触激活而是肽键水解激活(见蛋白水解酶),使成为因子Ⅻf。这是一正反馈效应,不论Ⅻa或Ⅻf都具有相同的活力。激活后的XIa在Ca2+存在下接着又使因子Ⅸ激活。因子Ⅻ是由596个胺基酸残基所组成,因子Ⅺ是由两个亚基所组成,每一亚基含607个胺基酸残基,其结构与血浆激肽释放酶很类似。 因子Ⅸ由416个胺基酸残基所组成,激活时释放出一肽段,形成由二硫键连结的两条肽链。与磷脂结合的部位在轻链,而酶的催化活性部位则在重链。活化的因子Ⅸa在Ca2+与磷脂存在下与因子Ⅷ形成复合物,使因子Ⅹ激活为因子Ⅹa。在正常生理条件下磷脂由血小板提供,在此反应中因子Ⅸa起酶催化作用,而因子Ⅷ只是起调节作用,由于它也能与因子Ⅹ结合,从而使局部的底物浓度增高。事实上单独因子Ⅸa也能使因子Ⅹ激活,但在因子Ⅷ参与下反应速度可增加数千倍以上。因子Ⅷ还需有因子Ⅹa及凝血酶的激活而成为因子Ⅷ',这里也是一正反馈效应。因子Ⅷ是一分子量达百万以上的糖蛋白,高盐浓度下解离成分子量约20万的亚基。若体内由于基因缺陷,因子Ⅷ欠缺或无活性,在临床上就表现出先天性血友病。因此因子Ⅷ又称为抗血友病因子。 因子Ⅹ是由448个胺基酸残基所组成,激活时释放出一肽段,形成由二硫键连结的两条肽链。它与因子Ⅸ相似,与磷脂及因子Ⅴ的结合部位在轻链,而酶的催化活性部位在重链。 激活后的因子Ⅹ与Ca2+、磷脂及因子Ⅴ共同形成一复合物,后者最终使凝血酶原激活为凝血酶。因子Ⅴ的性质与因子Ⅷ有很多相似之处,它不是起酶的催化作用,而是加速凝血酶原的激活,当因子Ⅴ与磷脂同时存在时激活过程可加速2万倍。同样因子Ⅴ也可被凝血酶激活成Ⅴ',成为另一正反馈效应。因子Ⅴ也是一大分子量的糖蛋白,由分子量约30万的亚基所组成,在体内极不稳定,容易被体内蛋白C(也是一种丝氨酸蛋白酶)所破坏,因此称为不稳定因子。 凝血酶原(即因子Ⅱ)由 581个胺基酸残基所组成,当被因子Xa复合物激活时,几乎同时在肽键Arg(精274)-Thr(苏275)及Arg(精322)-Ile(异亮323)处水解,并自N端释放出分子量约3万的肽段(残基1~274),形成由两条肽链通过二硫键连线的凝血酶。激活后的凝血酶又能催化降解凝血酶原,在残基Arg(156)-Ser(157)处的肽键水解,释放出A肽段并形成新凝血酶原-S,后者就不易再被Xa所激活。有人认为片段A通过Ca2+及磷脂与因子Xa相结合,如果此肽段被水解除去后,新凝血酶原-S就丧失与因子Xa结合的能力,即使它仍含有可被因子Χa专一水解的肽键,反应也极不易进行。这是凝血酶原激活过程的一个重要的负反馈调节机制,避免了体内由于产生过量凝血酶而引起血栓。 当凝血酶原激活时从N端释放的肽段,大致上可分为两个区域,即A肽段(残基1~156)及S-肽段(残基157~274)。此两肽段在胺基酸组成上特别是二硫键的位置非常相似,其中有31个胺基酸残基完全相同,在构型上似乎各自成为独立的单位,被称为“环饼”结构。一般认为此两环形结构能分别与因子Xa相结合,因而可在两个肽键处(残基274~275,322~323)同时水解而激活成凝血酶。如果只有残基 274处的肽键被因子Xa水解,生成的新凝血酶原-T则不能再激活成凝血酶。 外源性激活系统 体内组织损伤时释放出因子Ⅲ,也称为组织因子。在Ca2+存在下它能与血液中已活化的因子Ⅶ形成复合物,就能使因子Ⅹ激活,此后就与内源性激活途径的反应步骤相同。通过外源性途径血液凝固在10多秒钟内即可完成,而通过内源性途径则需数分钟。 因子Ⅲ为一膜糖蛋白,由263个胺基酸残基所组成,存在于血管内皮细胞,分布于体内各组织,在肺、脑、胎盘中更丰富。如果细胞膜受到损失它就随之释放。因子Ⅲ的作用类似于因子Ⅷ及Ⅴ,也是调节因子,不同的是,由于存在于膜上,因而无需血小板的磷脂参与。因子Ⅶ激活因子Ⅹ的机理类似于因子Ⅸ。上述内源或外源系统中各凝血因子Ⅻ、Ⅺ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅶ,凝血酶以及与凝血系统有关的激肽释放酶、蛋白C都属于丝氨酸蛋白酶,它们活性部位附近的胺基酸排列顺序都与胰蛋白酶极为相似,不同的是它们都是糖蛋白。 凝血因子 因子Ⅶ是由406个胺基酸残基所组成,激活时不释放出肽段,其结构与因子Ⅸ、Ⅹ很相似。 凝血因子与维生素K在凝血酶原近N端的肽段中有一种特殊胺基酸,即γ-羧基谷氨酸。由于在同一谷氨酸侧链中含有两个羧基,与Ca2+的亲合力就特别强。这样,凝血酶原就可通过Ca2+再与磷脂结合,这是因子Ⅹ激活凝血酶原所必需的。若动物给以维生素K的拮抗剂,如双羟香豆素,则在凝血酶原分子中原有的γ-羧基谷氨酸残基又被正常谷氨酸所取代,同时凝血机能也受到损害,由此认为维生素K是作为γ羧化酶的辅酶,在凝血酶原分子中总共有10个γ-羧基谷氨酸,它们都集中于N端32个胺基酸残基的肽段上(图3)。这就不难理解,一旦A肽段被凝血酶自身降解而除去后,留下的新凝血酶S就很难再被因子Ⅹa所激活。除凝血酶原外其他与维生素K有关的凝血因子还有因子 Ⅸ、Ⅹ及Ⅶ,还包括使因子Ⅴ、Ⅷ失活的蛋白C。它们在N端肽段附近都有类似的顺序,γ-羧基谷氨酸的位置也都不变,激活后都形成两条链,轻链为N端部分,含有γ-羧基谷氨酸,因而能与Ca2+及磷脂相结合。重链为C端部分,含有酶的催化中心。 纤维蛋白形成 从纤维蛋白原转变为纤维蛋白大致上可分为三个阶段: 纤维蛋白单体的形成 纤维蛋白原(因子Ⅰ)为一分子量约34万的糖蛋白,是由两个完全相同的亚基所组成,每一亚基又含有三条肽链,即α、β、γ 链,彼此通过二硫键相互连线。此三条肽链分别含610、461及410个胺基酸残基。两个亚基在肽链N端附近再通过三对二硫键将对称的二亚基连结起来(图4)。因此整个纤维蛋白原分子可用(Aα,Bβ,γ)2来表示,A、B分别代表被凝血酶自α、β肽链N末端水解释放的肽段,形成纤维蛋白后则用(α、β、γ)2来表示。在纤维蛋白分子中二硫键的位置相当集中,存在有所谓“二硫键节”的结构,其位置也靠近肽链的N端(图4)。β与γ肽链的胺基酸顺序很相似,特别近C端附近约有1/3是相同的。有人根据纤维蛋白原的理化性质提出了图5的模型,球体间的连线部分即为螺旋区,由三条肽链形成绳索状的螺旋结构。肽链C端球体的大小与形状类似血浆白蛋白,结构较紧密,并连线一条松散的α链C端肽段,容易被纤溶酶或其他蛋白酶所降解。 凝血因子 当凝血酶作用于纤维蛋白原时首先自 α链的 N端处释放出一16肽的肽段A,经过一滞后期后自β链的N端开始加速释放出一14肽的肽段B,剩下的部分即为纤维蛋白的单体。不同种属的纤维蛋白原A、B肽段的水解位置都在Arg(精)-Gly(甘)肽键上。肽段A、B的胺基酸组成可因不同种属而有很大差异,但都带有2~6个负电荷,并含有某些特殊胺基酸,如肽段A中含有带磷酸基的丝氨酸,肽段B中含有带硫酸基的酪氨酸。正因为肽段A、B带有净负电荷,使纤维蛋白原分子在未经凝血酶降解前,由于静电相斥而不能聚合。 纤维蛋白单体的聚合 在纤维蛋白单体的聚合过程中肽段A的释放起主要作用,先是首尾聚合,而肽段B的释放能使聚合加速并开始侧向聚合。纤维蛋白单体由于A、B肽段的释放,在每一亚基中暴露出两个相嵌的互补区,单体间就可藉非共价键首尾或侧向聚合,随着侧向聚合程度加深,血块显得粘稠,由透明转向不透明。 纤维蛋白的交联 激活后的凝血酶除降解纤维蛋白原释放肽段A、B外,在Ca2+存在下又同时迅速使因子ⅩⅢ激活,后者能使聚合的纤维蛋白在邻近的肽链间形成桥键,而成为稳定而交联的纤维蛋白多聚体,即使在5M尿素溶液中也不溶解,而交联前的凝胶在此条件下则可溶解。因子ⅩⅢ为转谷氨酰胺酶,它使肽链间赖氨酸残基上的ε氨基与谷氨酰胺残基上的γ酰胺基连结成新的肽键。每一纤维蛋白单体最多能形成6个共价桥键,若每分子内有2~3个,就可形成很稳定的交联纤维蛋白。 凝血因子 长期的进化使纤维蛋白原成为理想的止血剂,如在未激活前分子间由于静电相斥不能聚合而成为溶胶;位于肽链N端的A、B肽容易被凝血酶水解除去,随之静电效应消失,凝胶迅速形成;在肽链C末端附近又可再形成桥键,使成为稳定的凝胶并有足够的机械强度;分子量大,亲水性强、呈对称性,符合凝胶特性;分子中含一段绳索状螺旋结构区,容易被蛋白酶降解,在体内不致于形成血栓;纤维蛋白凝胶的降解产物具有抑制凝血酶的活力,也能阻止纤维蛋白单体的聚合,从而起到自身调节的反馈作用。 在凝血体系中除了各因子间的正负反馈及自身调节外,属于蛋白酶的凝血因子又受血浆中相应的蛋白酶抑制剂的制约,例如血浆中的抗凝血酶Ⅲ(ATⅢ,antithro-mbinⅢ),除能专一抑制凝血酶外,还能抑制因子Ⅹa、Ⅸa、及Ⅶa,特别对Ⅹa的抑制效果尤其显著。肝素能大大加速AT-Ⅲ的抑制作用,因而在临床上被用作重要的抗凝剂。除AT-Ⅲ外血浆中还有其他蛋白酶抑制剂,如α1抗蛋白酶、抗纤溶酶及α2巨球蛋白等,它们对凝血因子中的各蛋白酶也都有一定程度的抑制作用。 相关疾病 血友病(Hemophilia)是一组由于血液中某些凝血因子的缺乏而导致患者产生严重凝血障碍的遗传性出血性疾病,男女均可发病,但绝大部分患者为男性。包括血友病A(甲)、血友病B(乙)和因子XI缺乏症(曾称血友病丙)。前两者为性连锁隐性遗传,后者为常染色体不完全隐性遗传。血友病在先天性出血性疾病中最为常见,出血是该病的主要临床表现。治疗方法包括局部止血、替代疗法等。后者中新兴的疗法包括重组人凝血因子(注射用重组人凝血因子VIIIa,诺其)治疗,因其无人工污染,安全性高的特点,有日后普及的趋势。
特殊用途载体
载体(Vectors)DNA: 1)独立的一个包括启动子(promoter)、编码区(encoding region)和终止子(terminator)的基因,or 组成基因的某个元件,一般是不可以进入受体细胞的; 2)采用理化方法进入细胞后,也不容易在受体细胞内维持。所以,通过不同途径能将承载的外源DNA片段带入受体细胞,并在其中得以维持的DNA分子称为基因工程载体。
载体(Vectors)定义:在基因工程操作中,把能携带外源DNA进入受体细胞的DNA分子叫载体。
多克隆位点(multiple cloning site)ori复制起始点遗传标记pUCMCSAmpr运送外源基因高效转入受体细胞2、为外源基因提供复制能力或整合能力3、为外源基因的扩增或表达提供条件
载体的功能运送外源基因高效转入受体细胞为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因的扩增或表达提供必要的条件
目的基因能否有效转入受体细胞,并在其中维持高效表达,在很大程度上决定于载体。
基因工程对载体的要求(1)在宿主细胞内能独立复制,ori。(2)有选择性标记Ampr、Tetr、Kanr等。
(3)多克隆位点:外源基因插入的单一限制酶位点。(4)分子量小,可容纳较大的外源基因片段。(5)拷贝数多,方便外源基因在细胞内大量扩增。外源DNA插入其中不影响载体的复制且切点是单一的,这样可将多个外源DNA 片段插入其中。避免基因的非控制性扩散。(6)具有对受体细胞的可转移性。(7)具有较好的安全性,不能任意转移。
大肠杆菌质粒载体pBR322结构图克隆位点克隆位点遗传标记基因复制起点
载体的种类按功能分类克隆载体克隆一个基因或DNA片断表达载体用于一个基因的蛋白表达整合载体把一个基因插入到染色体组中
表达载体 用于一个基因的蛋白表达 整合载体 把一个基因插入到染色体组中按来源分类 质粒载体 噬菌体载体 柯斯质粒载体 人工染色体载体00
载体的种类和特征质粒 受体细胞结构插入片断举例Ecoli 环状<8kb pUC18/19 , T-载体等λ噬菌体线状
EMBL系列,λ gt系列丝状噬菌体及噬菌粒<10 kbM13mp系列粘粒载体35- 45kbpJB8,c2RB, pcoslEMBL, pWE15/16, pCVBAC (Bacterial Artificial Chromosome)≈300 kbPel oBAC系列YAC (Yeast Artificial chromosome )酵母细胞线性染色体kbMAC (Mammalian Artificial Chromosome)哺乳类细胞>1000 kb病毒载体动物细胞SV40 载体,昆虫杆状病毒载体穿梭载体和细菌pSVK3质粒,PBV, Ti质粒
第一节克隆载体1 质粒载体(plasimid vectors)2 噬菌体载体(phage vectors)
第一节克隆载体1 质粒载体(plasimid vectors)2 噬菌体载体(phage vectors)3 柯斯质粒载体(cosmid vectors)4 人工染色体载体(B/Y/HAC)
质粒的生物学特性(1)质粒的概念的裸露的环状双链DNA分子,比病毒更简单。
质粒是一种广泛从在于细菌细胞中染色体以外的能自主的复制的裸露的环状双链DNA分子,比病毒更简单。并不是寄主生长所必需的,但可以赋予寄主某些抵御外界环境因素不利影响的能力(带有抗性基因等)。
(2)质粒的大小差异很大,最小的只有1kb,只能编码中等大小的2-3种蛋白质分子,最大的达到200kb。质粒的生存在寄主细胞中“友好”地“借居”,它可以赋予寄主一些非染色体控制的遗传性状,以利于寄主的生存。比如,对抗菌素的抗性,对重金属的抗性等。(3)质粒的生存
严紧型复制控制的质粒(stringent plasmid)(拷贝数少,为1-5个)
(4)质粒的自主复制性质粒能利用寄主细胞的DNA复制系统进行自主复制。质粒DNA上的复制子结构决定了质粒与寄主的对应关系。根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分为两大复制类型:严紧型复制控制的质粒(stringent plasmid)(拷贝数少,为1-5个)松弛型复制控制的质粒(relaxed)(拷贝数多,可达10-200个拷贝)因此,作为载体的质粒应该是松弛型的。
(5)质粒的不相容性两个质粒在同一宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性。具有不相容性的质粒组成的群体称为不相容群,一般具有相同的复制子。
(6)质粒的可转移性在天然条件下,很多天然质粒都可通过细菌接合作用从一种宿主细胞内转移到另外一种宿主内,这种转移依赖于质粒上的tra基因产物。Conjugative plasmid 接合型质粒(自我转移的质粒):质粒可从一个细胞自发转移到另一个细胞。Non Conjugative plasmid 非接合型质粒(不能自我转移的质粒):由于失去控制细菌配对和自我转移的基因,质粒不能从一个细胞自发的转移到另一个细胞。基因工程一般只能利用非接接合型质粒,保证分子操作过程中质粒在细胞中的稳定性。
Tra protein from conjugative plasmid
bom siteMob genemob mRNAMob proteinopenrecipient cellhelper plasmid即mob基因的产物可打开非接合质粒的bom 位点(oriT位点),借助接合质粒tra基因的产物,使非接合质粒被动迁移到受体细胞中,这种现象称为迁移作用(mobilization)。
质粒DNA的tra基因 EColi产生菌毛 宿主与受体细胞结合 遗传物在细胞之间转移(指令)(迁移)大肠杆菌接合(conjunction)
(7)携带特殊的遗传标记野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传标记基因,这使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括:物质抗性抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物物质合成抗生素、细菌毒素、有机碱 这些标记基因对DNA重组分子的筛选具有重要意义
遗传标记基因定义:在基因工程中使用与选择重组体DNA转化细胞的基因1 指示外源DNA分子(载体或重组分子)是否进入宿主细胞2 指示外源DNA分子是否插入载体分子形成了重组子标记基因的作用
标记基因的种类1 抗性标记基因(可直接用于选择转化子)
a 抗生素抗性基因: Apr ,Tcr ,Cmr,Kanr,G418r,Hygr ,Neorb 重金属抗性基因: Cur ,Znr ,Cdrc 代谢抗性基因: TK,抗除草剂基因2 营养标记基因(可直接用于选择转化子)主要是参与氨基酸,核苷酸及其他必需营养物合成酶类的基因,这类基因在酵母转化中使用最频繁,如TRP1,URA3,LEU2,HIS4等。3 生化标记基因其表达产物可催化某些易检测的生化反应,如lacZ,GUS,CAT4 噬菌斑
1四环素抗性基因(Tcr)Tetracycline 可结合在核糖体30s亚基中的一种蛋白质分子上,抑制核糖体的转位过程。四环素抗性基因编码一种399 AAs蛋白质,与细菌细胞膜结合,阻止四环素分子进入细菌细胞。2氨苄青霉素抗性基因(Apr)Ampicillin可抑制细菌细胞膜上参与细胞壁合成酶类的活性。Apr抗性基因编码一种分泌到细菌细胞周间质的酶,催化β-内酰胺环的水解,使氨苄青霉素失活。3 氯霉素抗性基因(Cmr)Chlorophenicol可结合在核糖体50 S亚基上,阻止蛋白质合成。Cmr基因编码氯霉素乙酰转移酶,使氯霉素乙酰化,导致乙酰化的氯霉素不能结合在核糖体上。4 卡那霉素(Kanr), 新霉素(Neor)和G418抗性(G418r)基因Kanamycin,Neomycin和G418均属脱氧链霉胺氨基葡萄糖苷类抗生素,可结合在核糖体上阻止蛋白质的合成。来自转座子Tn5和Tn903的Kanr抗性基因均可使这类抗生素磷酸化,使之不能进入细胞内。20
质粒的存在形式有超螺旋、开环双螺旋和线状双螺旋三种。
(8)质粒的存在形式质粒的存在形式有超螺旋、开环双螺旋和线状双螺旋三种。双螺旋共价闭合环(超螺旋)线状双螺旋(两个裂口)开环双螺旋(一个裂口)
质粒空间构型与电泳速率同一质粒尽管分子量相同,不同的构型电泳迁移率不同:scDNA最快、l DNA次之、ocDNA最慢。OC L SC
天然质粒的局限性天然存在的野生型质粒由于分子量大、拷贝数低、单一酶切位点少、遗传标记不理想等缺陷,不能满足克隆载体的要求,因此往往需要以多种野生型质粒为基础进行人工构建。
质粒载体的命名原则人工组建的质粒人工组建的质粒的第一个字母是质粒英文名字(plasmid)的第一个字符p,用小写。p后有2个字母是大写,表示质粒的作者和实验室名称,再其后为质粒的编号。如pBR322,字母p代表质粒,BR是构建该质粒的研究人员的姓名,322代表…构建的一系质粒的编号。
质粒载体的发展概况第一阶段(1977年前) 天然质粒和重组质粒的利用,如pSC101, ColE1, pCR, pBR313和pBR322。第二阶段 增大载体容量(降低载体长度),建立多克隆位点区和新的遗传标记基因。如pUC系列载体。第三阶段 完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同要求,如M13mp系列载体,含T3,T7,sp6启动子载体,表达型载体及各种探针型载体。
质粒载体的构建质粒构建基本策略1加入合适的选择标记基因,如两个以上,易于选择转化体2增加或减少合适的酶切位点,便于重组
3缩短长度,提高导入效率,增加装载量4改变复制子,变严紧为松弛,变少拷贝为多拷贝5根据基因工程的特殊要求加装特殊的基因元件
1、选择合适的出发质粒: Ori、选择标记、MCS
质粒构建原则1、选择合适的出发质粒: Ori、选择标记、MCS2、正确获得构建质粒载体的元件:酶切、PCR3、组装合适的选择标记基因4、选择合适的启动子5、提高外源DNA的容量灭活一些有害基因,比如与质粒移动有关的基因,或影响质粒复制的负调控基因等。6、需要灭活初始质粒上的某些编码基因7、达到预期目的前提下,构建过程应力求简单
质粒载体:作为基因工程载体,质粒至少应该具备复制的起始区、选择标记基因区、多克隆位点等部分。
质粒载体的分类人工构建的质粒根据其功能和用途可分成如下几类:高拷贝质粒突变拷贝数控制基因拷贝数1000-3000 扩增基因
高拷贝质粒突变拷贝数控制基因拷贝数 扩增基因 低拷贝质粒来自pSC101 拷贝数小于10表达某些毒性基因 温敏质粒在不同温度下表现出拷贝数、整合等不同性质 测序质粒含有测序通用引物互补序列和多酶接头polylinker 整合质粒装有整合促进基因及位点 便于外源基因的整合 穿梭质粒装有针对两种不同受体的复制子 便于基因克隆 表达质粒装有强化外源基因表达的转录、翻译、纯化的元件 探针质粒装有报告基因 便于启动子等元件的克隆筛选
质粒载体的分类(1)高拷贝数的质粒载体ColE1、pMB1、pMB9 松弛型质粒。具有低分子量、高拷贝数的优点。
具有氯霉素扩增效应:每个细胞的拷贝数1000-3000个!用途:适合大量增殖克隆基因、或需要表达大量的基因产物。
(2)低拷贝数的质粒载体(3)温控的质粒载体由pSC101派生来的载体。特点是拷贝数低。pLG338、pLG339等
适合于克隆含量过高对寄主代谢有害的基因。减少蛋白质产物对寄主细胞的毒害。(3)温控的质粒载体一些低拷贝基因是温度敏感型,如pBEU1、pBEU2温度低(<37 oC),拷贝数很少;温度增加(>40 oC),拷贝数很快增加到>1000个。
(4)插入失活型质粒载体如pDF41、pDF42、pBR322。无抗生素抗性抗生素抗性
载体的克隆位点位于其某一个选择性标记基因内部。外源DNA片段插入会导致选择记号基因(如tetr、ampr、cmr等)失活。如pDF41、pDF42、pBR322。外源DNA无抗生素抗性抗生素抗性
质粒载体具有直接选择记号并赋予寄主细胞相应的表型。只有带有选择标记基因的转化菌细胞才能在选择培养基上生长。
(5)正选择的质粒载体质粒载体具有直接选择记号并赋予寄主细胞相应的表型。只有带有选择标记基因的转化菌细胞才能在选择培养基上生长。可大大降低需要筛选的转化子的数量,从而减轻实验的工作量,提高了选择的敏感性。通过选择具这种表型特征的转化子,便可大大降低需要筛选的转化子的数量只有带有选择标记基因的转化菌细胞才能在选择培养基上生长。目前通用的绝大部分质粒载体都是正选择载体。具有直接选择记号并赋予寄主细胞相应的表型,直接选择转化后的细胞,提高了选择的敏感性。注意启动子的性质,终止子、起始密码、终止密码的阅读正确。并能在大肠杆菌细胞中正常转录并转译成相应蛋白质的克隆载体特称为表达载体(expression vectors)。一种典型的大肠杆菌表达型质粒载体(图4-11)的主要组成部分,包括大肠杆菌的启动子及操纵全点序列、多克隆位点、转录及转译信号、质粒载体的复制起点及抗菌素抗性基因。
经典的大肠杆菌质粒载体pSC101质粒载体天然质粒,属严紧型低拷贝质粒。909 kb。四环素抗性Tetr。
ColE1天然质粒,属松弛型、高拷贝质粒,66Kb。有氯霉素扩增效应,每个细胞拷贝
大肠杆菌素(colicin)E1和对E1免疫的基因(immE1)
选择标记大肠杆菌素(colicin)E1和对E1免疫的基因(immE1)colicin E1能杀死不含ColE1 质粒的菌,形成噬菌斑。•colicin E1能杀死不含ColE1 质粒的菌,形成“噬菌斑”。•唯一的克隆位点EcoR I 正好位于这个基因的内部。可以通过插入失活筛选。
③不被其他细菌的colicin E1所杀死的原因
ceaimmkil结构基因免疫基因溶菌基因②杀死不含有ColE1细菌的原因cea + kil基因产物产生菌对细菌素有自身免疫性大肠杆菌所产生的细菌素称为大肠菌素(colicin),它除作用于某些型别的大肠杆菌外,还能作用于亲缘关系相近的志贺菌、沙门氏菌、克雷伯氏菌和巴氏杆菌等。③不被其他细菌的colicin E1所杀死的原因imm基因
EcoR I位于E1内部,插入外源DNA导致E1失活,使受体菌不能合成E(ColE1-),但仍表现出对E1免疫型(ImmE1+)。
唯一的克隆位点EcoR IEcoR I位于E1内部,插入外源DNA导致E1失活,使受体菌不能合成E(ColE1-),但仍表现出对E1免疫型(ImmE1+)。Colicin E1外源DNA无Colicin用对外源colicin E1的免疫性和自身不能合成colicin E1作选择,操作非常繁杂。
pBR322:人工构建载体p:质粒;BR:质粒两位主要构建者姓氏的第一个字母;322:实验编号三个亲本质粒:
pSF2124pMB1pSC101三个亲本质粒:pMB1:出发质粒(ColE1)pSF2124: AmprpSC101: Tetr把pBR322用限制性内切酶切去某片段,换上合用的表达组件,就可以构建成工作所需的新载体。436kb的环状双链DNA,碱基序列已经全部清楚。许多实用的质粒载体都是在pBR322的基础上改建而成。可见其原型质粒在使用上有优点。
3个会导致Ampr基因失活9个导致Tetr基因失活氨苄青霉素和四环素抗性24个单一克隆位点。
pBR322的优点①双抗生素抗性选择标记抗生素抗性基因的插入失活效应是检测重组体质粒的有效方法,分两次先后选择:没有获得载体的寄主细胞®在Amp或Tet中都死亡。获得重组载体的寄主细胞®在Amp或Tet其中之一中死亡。
不含质粒载体含有空质粒载体含有重组质粒载体AmpAmp+Tet
pBR322重组克隆的筛选重组克隆的“插入失活”筛选方法 pBR322—→插入在Tetr中,基因型为Tets 、Ampr——→在含有氨卞青霉素培养基上可生长,在含有四环素培养基上不生长; pBR322—→插入在Ampr中,基因型为Tetr 、Amps、——→在含有氨卞青霉素培养基上不生长,在含有四环素培养基可生长; 而在两种抗生素培养基上都生长的是非重组型。这种在一个基因位点中插入外源DNA片段,从而使该基因活性丧失的现象叫插入失活。
②分子小,克隆能力大③高拷贝数④安全⑤具有较多的单一酶切位点(24种)
长度4363bp,易于纯化,可以携带6-8Kb的外源DNA片段。③高拷贝数氯霉素扩增之后,每个细胞可1000~3000copies④安全失去了转移蛋白基因mob(mobilization)。不能通过接合转移。载体越小越好。>10kb的DNA在纯化过程中容易断裂。缺失流动基因(mob)。这样,质粒就不会从一个细菌接触转移到⑤具有较多的单一酶切位点(24种)
pBR322的缺点保留了转移蛋白(mob)的作用位点。能够被ColK质粒编码的mob蛋白识别,如果再有F质粒的参与,就有可能转移!
PBR322的改进①删除mob识别位点(如质粒pBR327、pAT153等)。pAT153:从pBR322上切去HaeII片断,既除去了mob识别位点,又增加质粒的拷贝数。
②改造EcoR I 位点pBR325:使EcoRI 也成为插入失活型位点。在pBR322位点上接入一段来自噬菌体PICm的HaeII酶切片断(带有氯霉素抗性基因cmlr)。cmlr上也带一个EcoRI位点。
pUC系列载体在pBR322的基础上改造而成。属正选择载体。pUC7、pUC8、pUC9、pUC10、pUC11、pUC18、pUC19
加入一个在5端带有10个多克隆位点的基因lacZ’
(1)元件来源a ori来自pBR322质粒的复制起点b 标记基因(ampr):pBR322的Ampr基因
Lacz基因编码的半乳糖苷酶是四聚体。Lacz’基因含有lacz基因的前59个密码子,a序列,编码a肽。c lacz’基因:大肠杆菌lac操纵子DNA区段,编码β-半乳糖苷酶a-肽链,是LacZ氨基端的一个片段载体用于可编码半乳糖苷酶羧基端部分序列的宿主细胞。d MCS 多克隆位点。
(2)克隆位点具有MCS(多克隆位点)区段:位于lacZ’基因的5’端。10个连续的单一限制酶切位点,但它不破坏该基因功能。
有mcs的存在,lacz’基因仍然能编码a肽。如果外源基因插入此mcs区,该基因失活。
x-gal:5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷,为生色底物,半乳糖苷酶+ x-gal 蓝色
菌落蓝白选择的原理:IPTG:异丙基-β-D-硫代半乳糖苷,乳糖类似物,又称为安慰诱导物,可代替乳糖诱导乳糖操纵子结构基因的表达,即可诱导lacz’所编码的半乳糖苷酶氨基末端片段(α-肽)的合成。x-gal:5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷,为生色底物,半乳糖苷酶+ x-gal蓝色x-gal水解后呈现蓝色
α-互补:pUC类载体带有lacz’基因,编码半乳糖苷酶氨基端片段(α-肽),此片段与宿主细胞所编码的羧基端半乳糖苷酶实现基因内互补,形成有功能的半乳糖苷酶,称α-互补。
α-互补(α-complementation)α-互补是指lacZ 基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半乳糖苷酶(β -galactosidase ,由1024 个氨基酸组成)阴性的突变体之间实现互补。α-互补是基于在两个不同的缺陷β-半乳糖苷酶之间可实现功能互补而建立的。大肠杆菌的乳糖lac 操纵子中的lacZ 基因编码β-半乳糖苷酶,如果lacZ 基因发生突变,则不能合成有活性的β-半乳糖苷酶。例如,lacZ△M15 基因是缺失了编码β-半乳糖苷酶中第个氨基酸的lacZ 基因,无酶学活性。对于只编码N-端140 个氨基酸的lacZ 基因(称为lacZ'),其产物也没有酶学活性。但这两个无酶学活性的产物混合在一起时,可恢复β-半乳糖苷酶的活性,实现基因内互补。
菌落蓝白斑选择的原理:在基因克隆时,细菌在含有IPTG和x-gal的培养基中进行培养。IPTG诱导质粒的lacz’基因产生α-肽,同时诱导细菌产生半乳糖苷酶的羧基端片段。两种片段形成有功能的半乳糖苷酶,从而使x-gal水解,产生蓝色物质,使非重组菌落呈现蓝色。当外源基因插到质粒的多克隆位点后,使lacz’失活,不能表达α-肽,破坏了互补作用,细胞内无有活性半乳糖苷酶,使带有重组质粒的细菌将产生白色菌落。
互补显色反应
a 具有更小的相对分子质量和更高的拷贝数,平均每个细胞可达500-700个拷贝
PUC载体的优点:a 具有更小的相对分子质量和更高的拷贝数,平均每个细胞可达个拷贝b 具有MCS片段,可把具有两种不同粘性末端的外源DNA片段直接克隆到pUC类载体上。26kbc 可以用组织化学方法检测重组体(蓝白斑筛选)
pGEM载体总长度为2743bp 含有一个氨卞青霉素抗性编码基因和一个lacZ’编码基因
一段含有EcoR I、Sat I、Kpn I、Ava I、Sma I、BamH I、XbaI、Sall、AccI、Hinc I、Pst II、Sph I和Hind II等识别序列的多克隆位点。此序列结构几乎与pUC18克隆载体的完全一样。
pGEM系列与pUC系列之间的主要差别pGEM具有两个来自噬菌体的启动子,即T7启动子和SP6启动子,它们为RNA聚合酶的附着作用提供了特异性的识别位点。由于这两个启动子分别位于Lac z’基因中多克隆位点区的两侧,故若在反应体系中加入纯化的识别T7或SP6启动子的RNA聚合酶,便可将已克隆的外源基因在体外转录出相应的mRNA。质粒载体pGEM-3Z和pGEM-4Z在结构上基本相似,两者之间的差别仅仅在于SP6和T7这两个启动子的位置互换、方向相反而已。pGEM 系列与pUC 系列之间的主要差别是,它具有两个来自噬菌体的启动子,即T7 启动子和SP6 启动子,它们为RNA 聚合酶的附着提供特异性识别位点。由于这两个启动子分别位于lacZ‘ 基因中多克隆位点区的两侧,若在反应体系中加入纯化的T7 或SP6 RNA 聚合酶,便可以将已经克隆的外源基因在体外转录出相应的mRNA 。质粒载体pGEM-3Z 和pGEM-4Z 在结构上基本相似,两者之间的差别仅仅在于SP6 和T7 这两个启动子的位置互换、方向相反而已。
pGEM-3Z:多拷贝装有多克隆位点(MCS)正选择颜色标记lacZ’ 装有两个噬菌体的强启动子用于外源基因的高效表达
注意:T7和SP6启动子特异性地由噬菌体DNA编码的RNA聚合酶所识别,因此相应的受体菌必须表达噬菌体RNA聚合酶,如:Ecoli BL21(DE3)等
穿梭质粒载体这种质粒分子上含有两个亲缘关系不同的复制子结构以及相应的选择性标记基因,因此能在两种不同种属的受体细胞中复制并检测,例如既能在原核生物中复制,又能在真核生物中复制的载体。这类载体既具有细菌质粒的复制原点及选择标记基因,还有真核生物的自主复制序列(ARS)以及选择标记性状通常穿梭载体在细菌中用于克隆,扩增克隆的基因,在酵母菌中用于基因表达分析穿梭载体(shuttle vector)是指含有两个亲缘关系不同的复制子,能在两种不同的生物中复制的。例如既能在原核生物中复制,又能在真核生物中复制的载体这类载体不仅具有细菌质粒的复制原点及选择标记基因,还有真核生物的自主复制序列(ARS)以及选择标记性状,具有多克隆位点通常穿梭载体在细菌中用于克隆,扩增克隆的基因,在酵母菌中用于基因表达分析61
用Taq酶的PCR产物3’端加上了一个A。根据这一特点研制出一种线性质粒,其5’端突出的T,它们之间可以连接,即TA克隆。
When it comes to treating diseases like cancer, modern medicine has an impressive arsenal And one of its most versatile weapons are Y-shaped proteins called monoclonal antibodies Our immune systems already produce their own antibodies (plasma cell), they come in billions of variations, each matching a specific target, such as a particular toxin, bacteria or virus When they bind to their target, they send a signal, this bacterium is now marked for destruction These naturally- produced antibodies are pretty effective In the 1970s, scientist figured out how to mass produce them
1如果一个相对分子质量为12000的蛋白质,含10种氨基酸,并假设每种氨基酸在该蛋白质分子中的数目相等,问这种蛋白质有多少种可能的排列顺序?[10100]
解:1012000/120=10100
2、有一个A肽,经酸解分析得知为Lys、His、Asp、Glu2、Ala以及Val、Tyr和两个NH3分子组成。当A肽与FDNB试剂反应后得DNP-Asp;当用羧肽酶处理后得游离缬氨酸。如果我们在实验中将A肽用胰蛋白酶降解时,得到两种肽,其中一种(Lys、Asp、Glu、Ala、Tyr)在pH64时,净电荷为零,另一种(His、Glu以及Val)可给除DNP-His,在pH64时,带正电荷。此外,A肽用糜蛋白酶降解时,也得到两种肽,其中一种(Asp、Ala、Tyr)在pH64时全中性,另一种(Lys、His、Glu2以及Val)在pH64时带正电荷。问A肽的氨基酸序列如何?[Asn-Ala-Tyr-Glu-Lys-His-Gln-Val]
解:1、N-末端分析:FDNB法得:Asp-;
2、C-末端分析:羧肽酶法得:-Val;
3、胰蛋白酶只断裂赖氨酸或精氨酸残基的羧基形成的肽键,得到的是以Arg和Lys为C-末端残基的肽断。酸水解使Asn→Asp+ NH4+,由已知条件(Lys、Asp、Glu、Ala、Tyr)可得:Asn-(
)-( )-( )-Lys-(
)-( )-Val;
4、FDNB法分析N-末端得DNP-His,酸水解使Gln→Glu+NH4+由已知条件(His、Glu、Val)可得:Asn-( )-( )-( )-Lys-His-Gln-Val;
5、糜蛋白酶断裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸残基的羧基端肽键。由题,得到的一条肽(Asp、Ala、Tyr)结合(3)、(4)可得该肽的氨基酸序列为:Asn-Ala-Tyr-Glu-Lys-His-Gln-Val
3、某多肽的氨基酸序列如下:Glu-Val-Lys-Asn-Cys-Phe-Arg-Trp-Asp-Leu-Gly-Ser-Leu-Glu-Ala-Thr-Cys-Arg-His-Met-Asp-Gln-Cys-Tyr-Pro-Gly-Glu_Glu-Lys。(1)如用胰蛋白酶处理,此多肽将产生几个肽?并解释原因(假设没有二硫键存在);(2)在pH75时,此多肽的净电荷是多少单位?说明理由(假设pKa值:α-COOH40;α- NH3+60;Glu和Asp侧链基40;Lys和Arg侧链基110;His侧链基75;Cys侧链基90;Tyr侧链基110);(3)如何判断此多肽是否含有二硫键?假如有二硫键存在,请设计实验确定5,17和23位上的Cys哪两个参与形成?[(1)4个肽;(2)-25单位;(3)如果多肽中无二硫键存在,经胰蛋白酶水解后应得4个肽段;如果存在一个二硫键应得3个肽段并且个肽段所带电荷不同,因此可用离子交换层析、电泳等方法将肽段分开,鉴定出含二硫键的肽段,测定其氨基酸顺序,便可确定二硫键的位置]
4、今有一个七肽,经分析它的氨基酸组成是:Lys、Pro、Arg、Phe、Ala、Tyr和Ser。此肽未经糜蛋白酶处理时,与FDNB反应不产生α-DNP-氨基酸。经糜蛋白酶作用后,此肽断裂城两个肽段,其氨基酸组成分别为Ala、Tyr、Ser和Pro、Phe、Lys、Arg。这两个肽段分别与FDNB反应,可分别产生DNP-Ser和DNP-Lys。此肽与胰蛋白酶反应能生成两个肽段,它们的氨基酸组成分别是Arg、Pro和Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala。试问此七肽的一级结构怎样?[它是一个环肽,序列为:-Phe-Ser-Ala-Tyr-Lys-Pro-Arg-]
解:(1)此肽未经糜蛋白酶处理时,与FDNB反应不产生α-DNP-氨基酸,说明此肽不含游离末端NH2,即此肽为一环肽;
(2)糜蛋白酶断裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸残基的羧基端肽键,由已知两肽段氨基酸组成(Ala、Tyr、Ser和Pro、Phe、Lys、Arg)可得:-(
)-( )-Tyr-和-( )-( )-(
)-Phe-;
(3)由(2)得的两肽段分别与FDNB反应,分别产生DNP-Ser和DNP-Lys可知该两肽段的N-末端分别为-Ser-和-Lys-,结合(2)可得:-Ser-Ala-Tyr-和-Lys-( )-( )-Phe-;
(4)胰蛋白酶专一断裂Arg或Lys残基的羧基参与形成的肽键,由题生成的两肽段氨基酸组成(Arg、Pro和Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala)可得:-Pro-Arg-和-( )-( )-( )-( )-Lys;
综合(2)、(3)、(4)可得此肽一级结构为:-Lys-Pro-Arg-Phe-Ser-Ala-Tyr-
5、三肽Lys- Lys- Lys的pI值必定大于它的任何一个个别基团的pKa值,这种说法是否正确?为什么?[正确,因为此三肽处于等电点时,七解离集团所处的状态是C-末端COO-(pKa=30),N末端NH2(pKa≌80),3个侧链3(1/3ε- NH3+)(pKa=1053),因此pI>最大的pKa值(1053)]
6、一个多肽可还原为两个肽段,它们的序列如下:链1为Ala-Cys-Phe-Pro-Lys-Arg-Trp-Cys-Arg- Arg-
Val-Cys;链2为Cys-Tyr-Cys-Phe-Cys。当用嗜热菌蛋白酶消化原多肽(具有完整的二硫键)时可用下列各肽:(1)(Ala、Cys2、Val);(2)(Arg、Lys、Phe、Pro);(3)(Arg2、Cys2、Trp、Tyr);(4)(Cys2、Phe)。试指出在该天然多肽中二硫键的位置。(结构如下图)
S-S
Ala-Cys-Phe-Pro-Lys-Arg-Trp-Cys-Arg-Arg-Val_Cys
S
S
Cys-Tyr-Cys-Phe-Cys
S-S
解:嗜热菌蛋白酶作用专一性较差,根据题中已知条件:
(1)消化原多肽得到(Ala、Cys2、Val),说明链1在2位Cys 后及11位Val前发生断裂,2位Cys与12位Cys之间有二硫键;
(2)由链1序列可得该肽段序列为:-Phe-Pro-Lys-Arg-;
(3)由(1)(2)可知该肽段(Arg2、Cys2、Trp、Tyr)中必有一Cys来自链2,另一Cys为链1中8位Cys,即链1中8位Cys与链2中的一个Cys有二硫键;
(4)嗜热菌蛋白酶能水解Tyr、Phe等疏水氨基酸残基,故此肽(Cys2、Phe)来自链2,结合(3)中含Tyr,可知(3)中形成的二硫键为链1 8位Cys与链2中3位Cys与链2中3位Cys之间;(4)中(Cys2、Phe)说明链2中1位Cys与5位Cys中有二硫键。
综合(1)、(2)、(3)、(4)可得结果。
7、一个十肽的氨基酸分析表明其水解液中存在下列产物:
NH4+ Asp Glu Tyr Arg
Met
Pro Lys Ser
Phe
并观察下列事实:(1)用羧肽酶A和B处理该十肽无效;(2)胰蛋白酶处理产生两个四肽和游离的Lys;(3)梭菌蛋白酶处理产生一个四肽和一个六肽;(4)溴化氢处理产生一个八肽和一个二肽,用单字母符号表示其序列为NP;(5)胰凝乳蛋白酶处理产生两个三肽和一个四肽,N-末端的胰凝乳蛋白酶水解肽段在中性pH时携带-1净电荷,在pH12时携带-3净电荷;(6)一轮Edman降解给出下面的PTH衍生物:
写出该十肽的氨基酸序列。[Ser-Glu-Tyr-Arg-Lys-Lys-Phe-Met-Asn-Pro]
解:(1)用羧肽酶A和B处理十肽无效说明该十肽C-末端残基为-Pro;
(2)胰蛋白酶专一断裂Lys或Arg残基的羧基参与形成的肽键,该十肽在胰蛋白酶处理后产生了两个四肽和有利的Lys,说明十肽中含Lys-…或-Arg-…-Lys-Lys-…或-Arg-Lys-…-Lys-…Arg-Lys-…四种可能的肽段,且水解位置在4与5、5与6或4与5、8与9、9与10之间;
(3)梭菌蛋白酶专一裂解Arg残基的羧基端肽键,处理该十肽后,产生一个四肽和一个六肽,则可知该十肽第四位为-Arg-;
(4)溴化氰只断裂由Met残基的羧基参加形成的肽键,处理该十肽后产生一个八肽和一个二肽,说明该十肽第八位或第二位为-Met-;用单字母表示二肽为NP,即-Asn-Pro-,故该十肽第八位为-Met-;
(5)胰凝乳蛋白酶断裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸残基的羧基端肽键,处理该十肽后,产生两个三肽和一个四肽,说明该十肽第三位、第六位或第七位为Trp或Phe;
(6)一轮Edman降解分析N-末端,根据其反应规律,可得N-末端氨基酸残疾结构式为:-NH-CH(-CH2OH)-C(=O)-,还原为-NH-CH(-CH2OH)-COOH-,可知此为Ser;
结合(1)、(2)、(3)、(4)、(5)、(6)可知该十肽的氨基酸序列为:
Ser-Glu-Tyr-Arg-Lys-Lys-Phe-Met-Asn-Pro
8、一个四肽,经胰蛋白酶水解得两个片段,一个片段在280nm附近有强的光吸收,并且Pauly反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性。另一片段用溴化氰处理释放出一个与茚三酮反应呈**的氨基酸。写出此四肽的氨基酸序列。[YRMP]
解:胰蛋白酶酶专一水解Lys和Arg残基的羧基参与形成的肽键,故该四肽中含Lys或Arg;一肽段在280nm附近有强光吸收且Pauly反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性,说明该肽段含Tyr和Arg;溴化氰专一断裂Met残基的羧基参加形成的肽键,又因生成了与茚三酮反应呈**的氨基酸,故该肽段为-Met-Pro-;所以该四肽的氨基酸组成为Tyr-Arg-Met-Pro,即YRMP。
9、蜂毒明肽(apamin)是存在蜜蜂毒液中的一个十八肽,其序列为CNCKAPETALCARRCQQH,已知蜂毒明肽形成二硫键,不与碘乙酸发生反应,(1)问此肽中存在多少个二硫键?(2)请设计确定这些(个)二硫键位置的策略。
[(1)两个;(2)二硫键的位置可能是1-3和11-15或1-11和3-15或1-15和3-11,第一种情况,用胰蛋白酶断裂将产生两个肽加Arg;第二种情况和第三种,将产生一个肽加Arg,通过二硫键部分氧化可以把后两种情况区别开来。]
10、叙述用Mernfield固相化学方法合成二肽Lys-Ala。如果你打算向Lys-Ala加入一个亮氨酸残基使成三肽,可能会掉进什么样的“陷坑”?
解:(1)用BOC保护Ala氨基端,然后将其羧基挂接在树脂上;
(2)除去N端保护,将用BOC保护的Arg用缩合剂DDC与Ala相连;
(3)将把树脂悬浮在无水三氟乙酸中,通人干燥的HBr,使肽与树脂脱离,同时保护基也被切除。
若打算向Lys-Ala加入一个亮氨酸残基使成三肽,可能的坑为:Leu可能接在Arg的非α-氨基上。
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