mega328p是什么单片机用的什么编程软件

意法半导体（STMicroelectronics）的超低功耗MCU系列采用低泄漏技术和优化设计，以实现出色的低电流消耗，使其非常适合电池供电和能量收集应用。为了充分利用这些器件的低功耗功能，有必要知道可用的低功耗模式，如何配置它们以及最适合哪些任务。本文概述了STM32L053C8 MCU上的低功耗模式。但是，由于该系列的低功耗模式相同，因此可以使用任何STM32L0器件。 STM32L1系列和STM32L4系列还包括在超低功耗系列中。这些器件是性能更高的产品，具有更高级的内核，更多的内存和更多的外围设备。它们具有与L0系列相同的低功耗模式（对于L4系列，还具有一些其他功能），因此，本文也是从了解L4系列的好入门。图1摘自ST的宣传册之一，简要总结了L0、L1和L4系列的功能和优点。

图1：STM32超低功耗产品系列的比较

当使用ST的MCU进行任何工作时，应该有两个可用的文档。首先是参考手册，对于STM32L053C8，则是STM32L0x3参考手册。本文档包含有关STM32L0x3系列的详细信息，即如何使用存储器和外设集。有关产品线中特定设备的更多详细信息，例如引脚映射、电气特性和封装信息，应使用数据表作为参考。就低功耗模式而言，参考手册将明确详细说明如何进入和退出它们，而数据手册将专门定义外围设备的可用性、可能的唤醒源和电流消耗估算。

背景介绍

STM32L0基于Cortex-M0 +内核，这意味着其低功耗功能取决于该内核的电源管理功能。可以使用系统控制块中的系统控制寄存器（SCR）来配置这些功能。不幸的是，参考手册或数据表中都没有记录内核寄存器。 ST则为那些寻求有关Cortex-M0 +的简洁文档的人员提供了STM32L0系列Cortex-M0 +编程手册。有关Cortex-M0、M0 +和M1内核的完整文档，可以在《 ARMv6-M体系结构参考手册》中找到。这两个文档都有一个关于电源管理的部分，这是开始本主题的好地方。

图2：SCR寄存器位

如图2所示，SCR由三位组成：SEVONPEND、SLEEPONEXIT和SLEEPDEEP。 SEVONPEND（发送事件在待命状态）位允许中断进入待命状态以触发唤醒事件。请注意，如果未在NVIC中启用这些中断，则仍会产生唤醒事件，但不会输入ISR。有关未决中断，使能中断或一般而言NVIC的更多信息，请参见前述Cortex-M0 +手册中的“嵌套向量中断控制器”部分。 SLEEPONEXIT位提供了一个选项，可以在异常恢复后使处理器继续执行程序之前将处理器置于低功耗模式。对于仅需要唤醒服务中断的应用程序来说，这是理想的选择。最后，SLEEPDEEP位允许进入深度睡眠状态，而不是常规睡眠状态。利用Cortex-M0 +内核的芯片制造商可以确定这些状态下设备的确切性能。睡眠状态用作睡眠模式和低功耗睡眠模式的基础，而深度睡眠状态用作停止模式和待机模式的基础。

有三种方法可以在Cortex-M0 +上进入低功耗模式。第一种是使用WFI（等待中断）指令。顾名思义，如果设备由于该指令而进入低功耗模式，则中断（在NVIC中启用）能够唤醒设备。进入低功耗模式的第二种方法是执行WFE（等待事件）指令。这与WFI指令非常相似，但具有更大的灵活性。不仅可以通过扩展中断和事件控制器（EXTI）中配置的事件唤醒设备，还可以通过NVIC中禁用的中断（只要它们在相应的外设控制寄存器中启用）唤醒。已经提到了进入低功耗模式的第三种方法。通过将SCR中的SLEEPONEXIT位置1，异常返回将使设备进入低功耗模式，就像执行WFI指令一样。请注意，在所有这些情况下，仅当没有中断或事件挂起时才进入低功耗模式。由于不能保证WFI和WFE会中止程序执行，因此通常将它们称为“提示指令”。

值得一提的最后一个内核寄存器是PRIMASK寄存器。它仅包含一个可配置位PM（可优先中断屏蔽），如果将其设置为1，它将禁用所有具有可配置优先级的中断。如果首先需要将系统恢复到工作状态，这不仅可以用于执行原子操作，而且可以延迟执行ISR。在详细说明停止模式的部分中将提供一个示例。

为了使程序员在开发C应用程序时轻松访问WFI和WFE指令，CMSIS-CORE标准提供了__WFI()和__WFE()函数。以下各节中的所有示例函数都使用__WFI()执行WFI指令并进入低功耗模式。另外，CMSIS不会直接提供对PRIMASK寄存器的访问，而是实现__disable_irq()和__enable_irq()函数，以便分别设置和清除PM位。为了检查PM位的状态，__ get_PRIMASK()函数将返回其当前状态。大多数IDE使将CMSIS驱动程序添加到项目变得非常简单。例如，在Keil中，请确保在包安装程序中安装了ARM :: CMSIS，并在创建新项目时在运行时环境管理器中仅检查“ CORE”包（在CMSIS组件）。

低功耗模式（Low-Power）

STM32L0器件实现了五种低功耗模式：低功耗运行模式、睡眠模式、低功耗睡眠模式、停止模式和待机模式。这些模式之间的差异可以用功耗，性能、唤醒时间和唤醒源来描述。如果对于这些参数中的每一个，将模式按从最佳（1）到最差（5）的顺序进行排序，则可以清楚地了解哪些取舍。一般而言，随着功耗的下降；性能下降，唤醒时间增加，唤醒源数量减少。表1总结了低功耗模式的排名。作为、示例，请考虑低功耗运行模式。它具有最佳的性能、最多的唤醒源，第二快的唤醒时间和第四低的电流消耗。

表1：基于各种工作参数的STM32L0低功耗模式的排列

在本节中，将很清楚如何得出这些排名。但是，重要的是要及早意识到它们仅在一般意义上是正确的。例如，停止模式完全有可能比低功耗睡眠模式消耗更多电流，这取决于它们的配置以及启用/禁用的外设。但是通常情况并非如此，因为停止模式对设备功能的限制远比低功耗睡眠模式所限制，以节省更多功率。

低功耗运行模式（Low-Power Run）

将其作为低功耗模式推销是相当诱人的，因为它节省能耗的主要方法是要求较低的系统时钟频率。将任何微控制器的时钟速度降低到千赫兹范围将极大地降低电流消耗，使其与普通睡眠模式相比更具竞争力。但是，通常不这样做的原因是，从长远来看，性能的降低以及静态电流消耗（不取决于时钟频率）会消耗更多的能量。取决于应用，即正在使用哪种睡眠模式或设备唤醒的频率，在较短的时间段内消耗更多的电流而不是在较长的时间段内消耗较少的电流可能更有效。 ST之所以可以将其分类为低功耗模式，是因为它们提供了将内部稳压器置于低功耗状态的能力。这将减少设备消耗的静态电流，从而将其对性能与总电流消耗之间的折衷影响降至最低。

为了将调节器切换到低功耗模式，必须满足两个条件。首先，调节器电压（VCORE）必须在2范围内。幸运的是，根据PWR_CR寄存器文档，这是调节器的默认配置。因此，除非利用器件的动态电压缩放功能，否则无需担心此先决条件。第二个条件是系统频率不超过fMSI范围1。根据MSIRANGE位的描述（在RCC_ICSCR寄存器中），它对应于大约131072 kHz的频率。在这种速度和功率水平下，USB，ADC和TSC（触摸感应控制器）外围设备不可用。更改系统频率后，必须重新初始化之前在运行模式下初始化的所有与频率相关的外围设备（USART、计时器等），以便继续正常运行。

与其他低功耗模式不同，CPU不会在低功耗运行模式下停止。这意味着它不是通过前面讨论的WFI / WFE指令输入的，而是通过设置PWR_CR寄存器中的LPSDSR（低功耗睡眠-深度/睡眠/低功耗运行）和LPRUN（低功耗运行）位来输入的。 。请注意，必须在设置LPRUN之前设置LPSDSR，在清除LPSDSR之前必须清除LPRUN，并且在进入任何其他低功耗模式之前应清除LPRUN。由于程序在低功耗运行模式下继续执行，因此该设备被软件“唤醒”，而不是局限于有限的一组中断或事件。只需清除LPRUN位并使系统频率恢复到全速，即可使系统返回运行模式。清单1显示了使用参考手册中概述的步骤进入低功耗运行模式的整个过程。清单2演示了当设备不再需要处于低功耗运行模式时如何重新进入运行模式。

清单1：进入低功耗运行模式的示例

void enter_LPRun( void )

{

/ 1 Each digital IP clock must be enabled or disabled by using the

RCC_APBxENR and RCC_AHBENR registers /

RCC->APB1ENR |= RCC_APB1ENR_PWREN;

/ 2 The frequency of the system clock must be decreased to not exceed the

frequency of f_MSI range1 /

Config_SysClk_MSI_131();

// Reinitialize peripherals dependent on clock speed

USART1_Init();

SysTick_Init( 0001 );

I2C1_Init();

/ 3 The regulator is forced in low-power mode by software

(LPRUN and LPSDSR bits set ) /

PWR->CR &= ~PWR_CR_LPRUN; // Be sure LPRUN is cleared!

PWR->CR |= PWR_CR_LPSDSR; // must be set before LPRUN

PWR->CR |= PWR_CR_LPRUN; // enter low power run mode

}

清单2：进入运行模式的示例

void enter_Run( void )

{

/ Enable Clocks /

RCC->APB1ENR |= RCC_APB1ENR_PWREN;

/ Force the regulator into main mode /

// Reset LPRUN bit

PWR->CR &= ~( PWR_CR_LPRUN );

// LPSDSR can be reset only when LPRUN bit = 0;

PWR->CR &= ~( PWR_CR_LPSDSR );

/ Set HSI16 oscillator as system clock /

Config_SysClk_HSI16();

// Reinitialize peripherals dependent on clock speed

USART1_Init();

SysTick_Init( 0001 );

I2C1_Init();

}

睡眠模式（Sleep Mode）

睡眠模式是低功耗模式中最简单的一种，它以最省电的方式提供最短的唤醒时间。数据手册指出，在禁用所有外设且系统频率为16 MHz的情况下，将消耗约1 mA的电流。这远高于其他低功耗模式，后者可以实现微安或什至纳安的数量级。但是，唤醒时间几乎是最具竞争力的低功耗模式的十倍。表2显示了设备从每种低功耗模式唤醒并进入运行模式所花费的时间。唤醒时间的值取自数据表的表4。

表2：每种低功耗模式的唤醒到运行模式时间

在休眠模式下，所有外设继续运行时，仅内核停止运行。由于不必降低系统频率并且所有设备的外围设备都可以使用，因此这使进入睡眠模式几乎毫不费力。同样，退出休眠模式非常容易，因为在运行模式下可用的任何中断或事件都可以唤醒设备并以极低的延迟进行服务。因此，几乎在CPU处于自旋锁等待事件发生的任何情况下都可以使用睡眠模式。用户无需进入繁忙等待循环，只需执行WFI或WFE（取决于唤醒方法）即可暂停执行并节省功耗，直到再次需要内核为止。这

《口袋妖怪》mega觉醒作弊码有哪些？

胡地石-凯那市市集

喷石-烟突山底部-热焰小径

Y喷石-120公路-天旱焦岩

灾兽石-野生原野区

大嘴娃石-117号道路近绿荫镇交界花圃下面

雷电兽石- 110号路自行车道下

波士可多拉石-卡绿隧道里用碎岩帮助情侣相会后男子赠送

恰雷姆石-送神山坟场顶楼

诅咒娃娃石-送神火山外部山顶

袋龙石-暮水镇

X梦石-未白镇博士研究所旁

Y梦石-联盟门口外

赫拉克罗斯石-127号水路

大甲石-124水路(需要潜水)

巨钳螳螂石-森林里

耿鬼石-对战边疆某屋子里

黑鲁加石-釜炎镇温泉下方

化肥石-流星瀑布中

暴雪王石-123路树果名人之家花园

巨甲石-烟突山山腰-凹凸山道

沙奈朵石-绿荫镇某民屋

电龙石-新紫堇

暴鲤龙石-123路钓鱼屋中跟土狼犬对话后获得

水箭龟石-破浪号甲板上

妙娃花石-119路小屋前的长草雷电兽石- 110号路自行车道下

波士可多拉石-卡绿隧道里用碎岩帮助情侣相会后男子赠送

恰雷姆石-送神山坟场顶楼

诅咒娃娃石-送神火山外部山顶

袋龙石-暮水镇

X梦石-未白镇博士研究所旁

Y梦石-联盟门口外

赫拉克罗斯石-127号水路

大甲石-124水路(需要潜水)

ORAS新mega:

拉帝亚斯石/拉迪欧斯石-得到5个徽章后触发剧情和大吾前往南方小岛自动获得（无需战斗），

同时得到mega环，开始可以使用mega进化功能（根据版本）

拉迪欧斯石/拉帝亚斯石-跟老妈对话后获得（根据版本）

迪安西石-把迪安西放在首位进入任意精灵中心触发剧情获得

蜥蜴王石/火鸡石/巨沼怪石-120号道路吊桥上和大吾对话触发变隐龙剧情后，大吾将侦测望远

镜送给了主角，并根据主角选择的御三家赠送给主角相应的Mega石

勾魂眼石-琉璃市觉醒祠堂右边

喷火驼石-DELTA章剧情赠送（另一版本为巨牙鲨石？）

巨牙鲨石-战斗边疆前剧情赠送（另一版本为喷火驼石？）

大钢蛇石-某山洞里

巨金怪石-初回配信/二周目挑战联盟打败大吾后获得

暴蝾螈石-DELTA章后到流星瀑布下与NPC对话获得

裂空座Mega进化无需石头，只需学会独门即可，忘掉独门后无法Mega进化

塔布奈石-对战边疆救起了失忆的帅哥刑警后,在小屋再次对话后赠送

艾路雷朵石-秋叶镇跟索蓝斯博士对话后获得

冰鬼护石-浅滩洞穴深处(溯退)

大针蜂石-完成废船剧情后可以捡取

呆河马石-浅滩洞穴中替老人收集好材料后赠送

其余两个御三家石-114路蹲坐的老人，向他买剩下的两颗御三家石头，两颗石均以1500元发售

比雕石-在绿荫镇帮小女孩找寻蘑蘑菇后得到奇妙石，再到得文公司跟社长对话后获得

长耳兔石-紫堇市二楼住宅居帮助西装男后再次对话后获得

七夕青鸟石-带上七夕青鸟到水静市找某男子,给他看七夕青鸟后获得

你好，mega进化没有等级限制，只要是可以mega的精灵携带了对应的mega石，且玩家本身携带钥石，就能在对战中进行mega进化

这是目前所有能mega进化的精灵

https://wiki52pokecom/wiki/%E8%B6%85%E7%BA%A7%E8%BF%9B%E5%8C%96

希望可以帮到你

这不得把设计团队都开了？还得跳楼。

外观好不好看不重要，最重要的是里面的大电视！

这就是理想MEGA试制车曝光后的热门评论，迎来的不是网友的期待，而是纷纷热议车外观造型是真的丑，还有眼尖的网友，一眼看出这个造型非常熟悉，这不就是抄袭现代吗？当然还有网友抓住了重点，那就是这中控要装多大的电视啊？作为理想即将推向市场的首款纯电MPV，能源形式已经不是消费者讨论的重点，而是专注在设计、体验上，那理想的破局之路也就很明晰了，在智能座舱中持续创新。

外观还没敲定，但能看到空间的大

虽然都说外观丑，但理想MEGA大概率不会长这样，也许它会比L9更大约10%。

<img src="https://imagebitautoimgcom/appimage-702-w0/mapi/news/2023/08/10/ee6614407d824b9a828354bf9e56b4bdpng" class="imgborder" alt="雪地里行驶的汽车

描述已自动生成">

从目前曝光出的照片，其实很容易就能看出理想MEGA的特点十分鲜明，外观设计上呈现出流线型设计，车头机舱压缩的比较小，如此流线型的设计为的就是降低风阻，细节上就能看出大灯位置相对较低，A柱有着大面积三角窗来减少盲区，而前挡风玻璃上方有着激光雷达。不过需要注意的是，这次理想MEGA曝光的则是硬质样件模型车，在外观上并没有定型，理想MEGA最终的成品大概率不会是现在的韩国现代STARIA翻版，其实当下这一版车型早就有所曝光，不过李想曾在微博中就表示：“真设计成这鸟样，我就把设计团队都干掉，顺便自己跳楼”，已经立了如此高的flag，再与曝光出的渲染图设计一致，对于理想品牌的口碑会是一个比较大的影响，得不偿失。

而在尺寸上，理想MEGA将会超过53米，结合压缩的车头机舱，将会有着非常可观的车内空间，因为用纯电不需要增程器，车辆后部占用被解放，而且车头机舱相比L9压缩明显，车内的空间相比L9预计大10%。并且从内部设计来看，并且能够看出第二排的滑轨设计很长，这可能也是理想MEGA在大空间的基础上对于智能座舱进行升级的一个基础，而理想MEGA想要在市场上立足，智能座舱的升级才是重中之重。

AR、XR还是投影？MEGA智能座舱还能怎么创新？

当下的纯电动MPV市场，月销过三千都寥寥无几，理想做纯电，智能座舱才是最终发力点。

理想到目前为止的成功之处，与理想在对汽车智能座舱、车内空间体验是强相关的，尤其将车内娱乐这一件事做的更符合消费者需求，那么作为理想纯电MPV的MEGA，想要留住消费者会在智能座舱的体验上做足、做够。

<img src="https://imagebitautoimgcom/appimage-960-w0/mapi/news/2023/08/10/940e235e911c46c2822aec74d070ffbepng" class="imgborder" alt="汽车的发动机

描述已自动生成">

从目前曝光出的理想MEGA，在前排的内饰设计上与理想L9基本一致，都是采用中控副驾双联屏设计，这一设计在理想L9上备受好评，后续正式发布之时MEGA上采用同款设计也是能够理解的。而最大的悬念其实就是MPV的重头戏，后排的智能座舱如何进行创新。

参考理想L9后排采用了一个157英寸OLED屏幕，这块屏幕就专门为二三排乘客设计的，结合L9对于座椅放倒后的休憩模式，能够躺着观影、娱乐就是理想对于后排智能座舱最好的理解，也是消费者所认可的，那么理想MEGA要做的也十分好理解了，就是能让用户看的更爽快。

<img src="https://imagebitautoimgcom/appimage-960-w0/mapi/news/2023/08/10/aa3edaeabc6741b99c765e8e20cf32a3png" class="imgborder" alt="包含 室内, 食物, 风景, 覆盖

描述已自动生成">

强交互下，在屏幕的基础上再进行智能座舱的创新，AR、VR、投影这三个方面是有可能成为理想MEGA的创新点，其中AR/VR代表了未来车载娱乐的发展方向，是一个值得试水的场景，而投影就是对于理想MEGA大车内空间的多人娱乐最便捷的解决方法，不过这些都是源于纯电的理想MEGA能够更好的解除能源上的掣肘，才能做到更加专注的发挥智能化能力的选择，所以最终AR、VR或是对于功率要求更高的投影都能够成为一个选择。

这是由于当下理想所采用的增程式动力，由于系统设计更加复杂，绕不开发动机、发电机、电池以及驱动电机，想要保持行车驱动电机输出同时更好的调配电池电量，以及发动机的运转工况控制，这些都是需要软件算法进行调控，才能更好的分配电力，尤其在车辆电量低时高负载时，这对于整车的电力输出分配是有着一定影响的，还是会优先驱动和自动驾驶，这对于理想来说，这方面的考量也就限制了当下理想汽车在智能座舱方面的发挥。

但是选择了纯电的理想MEGA就能解除这样的“枷锁”，首先理想MEGA在车内的车机芯片上可以选择算力更高、更新的高通骁龙8295，作为高通面向PC产品推出的8cx Gen3的车载版本，高通骁龙8295在功耗上相对更高，但GPU性能以及AI算力都有了大幅度的提升，这就为接下来的智能座舱打造开辟了新的发挥空间。

我觉得，如果激进一些，理想MEGA会选择在后排搭载AR屏幕。当下智能座舱对于AR的竞争已经逐渐展开，蔚来联合Nreal推出了车内AR眼镜配件NIO Air AR Glasses，而华为也在2023华为智能汽车解决方案发布会上展现了基于AR-HUD根技术实现的HUAWEI xScene光场屏，当下车内的算力已经足以支撑AR屏幕的应用，唯一的取舍就是想要怎么做，当下无论是AR眼镜还是AR屏幕，都比较适合个人的娱乐，AR眼镜是属于自己的个人“剧场”，而像HUAWEI xScene光场屏则是座椅后方显示器的替代，想要做成大屏AR目前还比较困难。

所以，理性的讲，理想最有可能的则是在后排选择投影的形式来解决娱乐功能，首先是由用户需求驱动，如果浏览当下汽车论坛、车友群，可以发现很多消费者会选择将车辆后排放倒，自行挂一个投影幕布，并利用便携式投影仪享受车内大屏观影的乐趣。对于消费者来说，大屏就是最大的娱乐需求。

理想MEGA作为53以上长度的MPV，如L9一样仅靠一块157英寸的屏幕显然不够用，但大尺寸硬屏在车内空间中很难实现，投影就是一个非常不错的解决方案。但便携式的投影在亮度方面很难在白天看清，想要获得更好的画质，就需要更大的功率，相比日常不足百瓦功率的显示器，投影动辄200W-300W的功率，这在理想此前增程模式下的电力分配中很难去放手实现，但理想MEGA纯电的设计就能很好的解决这一问题。

不过投影的实现，不但能够解决后排观影的沉浸感，让车内作为“家”的属性更贴合，如果在高通骁龙8295的乘客监测新特性加持，以及更大车内空间和AI算力的提升，还可以在交互上更进一步，理想可以考虑加入比如体感操作、语音游戏的操作，充分发挥芯片的高算力以及新特性，用上投影后，这些都是在理想MEGA智能座舱中可以实现的功能。

写在最后：

其实对于理想来说，理想MEGA作为理想双能源布局中纯电第一作，能够卖出去才是最终的目的，当下纯电MPV这一细分领域中的玩家销量都不太好，理想需要做的就是用心做好车内智能座舱的体验，以用户需求为导向，尤其是在增程时代无法发挥的方面，比如高功率投影这样的用户需求，正是理想需要考虑的。而对于“微博之王”李想，他的那句“理想MEGA将成为50万以上销量第一的产品”，重要吗？

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木星卫星列表 名称 编号 直径(km) 质量 (kg) 木卫一 艾奥 1 3643 900E+21 木卫二 欧罗巴 2 3122 500E+21 木卫三 盖尼米得 3 5262 150E+22 木卫四 卡利斯托 4 4821 110E+22 木卫五 阿曼尔提亚 5 262×146×134 200E+17 木卫六 希马利亚 6 170 700E+17 木卫七 艾拉华 7 86 870E+16 木卫八 帕西法尔 8 60 300E+16 木卫九 希诺佩 9 38 700E+15 木卫十 丽西提亚 10 36 600E+15 木卫十一 加尔尼 11 46 130E+16 木卫十二 安纳金 12 28 300E+15 木卫十三 雷塔 13 20 100E+15 木卫十四 亚特斯提尔 14 S/1979 J 2 110×90 100E+17 木卫十五 阿德拉斯蒂尔 15 S/1979 J 1 26×20×16 750E+14 木卫十六 墨提斯 16 S/1979 J 3 43 120E+16 木卫十七 Callirrhoe S/1999 J 1 9 900E+13 木卫十八 Themisto S/1975 J 1 8 700E+13 S/2000 J 1 木卫十九 Megaclite S/2000 J 8 5 200E+13 木卫二十 Taygete S/2000 J 9 5 200E+13 木卫二十一 Chaldene S/2000 J 10 4 750E+12 木卫二十二 Harpalyke S/2000 J 5 4 100E+13 木卫二十三 Kalyke S/2000 J 2 5 200E+13 木卫二十四 Iocaste S/2000 J 3 5 200E+13 木卫二十五 Erinome S/2000 J 4 3 450E+12 木卫二十六 Isonoe S/2000 J 6 4 750E+12 木卫二十七 Praxidike S/2000 J 7 7 400E+13 木卫二十八 Autonoe S/2001 J 1 4 900E+12 木卫二十九 Thyone S/2001 J 2 4 900E+12 木卫三十 Hermippe S/2001 J 3 4 900E+12 木卫三十一 Aitne S/2001 J 11 3 450E+12 木卫三十二 Eurydome S/2001 J 4 3 450E+12 木卫三十三 Euanthe S/2001 J 7 3 450E+12 木卫三十四 Euporie S/2001 J 10 2 150E+12 木卫三十五 Orthosie S/2001 J 9 2 150E+12 木卫三十六 Sponde S/2001 J 5 2 150E+12 木卫三十七 Kale S/2001 J 8 2 150E+12 木卫三十八 Pasithee S/2001 J 6 2 150E+12 木卫三十九 Hegemone S/2000 J 11 4 900E+12 木卫四十 Mneme S/2002 J 1 3 450E+12 木卫四十一 Aoede S/2003 J 1 4 900E+12 木卫四十二 Thelxinoe S/2003 J 2 2 150E+12 木卫四十三 Arche S/2003 J 3 2 150E+12 木卫四十四 Kallichore S/2003 J 4 2 150E+12 木卫四十五 Helike S/2003 J 5 4 900E+12 木卫四十六 Carpo S/2003 J 6 4 900E+12 木卫四十七 Eukelade S/2003 J 7 4 900E+12 木卫四十八 Cyllene S/2003 J 8 3 450E+12 - S/2003 J 9 1 100E+11 - S/2003 J 10 2 150E+12 - S/2003 J 11 2 150E+12 - S/2003 J 12 1 100E+11 - S/2003 J 13 2 150E+12 - S/2003 J 14 2 150E+12 - S/2003 J 15 2 150E+12 - S/2003 J 16 2 150E+12 - S/2003 J 17 2 150E+12 - S/2003 J 18 2 150E+12 -

参考: zh /wiki/%E6%9C%A8%E6%98%9F%E7%9A%84%E5%8D%AB%E6%98%9F

木星有63颗卫星，是太阳系中已知拥有最多卫星的行星，其中有48颗已命名，包括4颗大型伽利略卫星。 卫星名称 木卫十六 Metis 木卫十五 Adrastea 木卫五　 Amalthea 木卫十四 Thebe 木卫一 Io 木卫二 Europa 木卫三 Ganymede 木卫四 Callisto 木卫十八 Themisto 木卫十三 Leda 木卫六 Himalia 木卫十 Lysithea 木卫七 Elara S/2000 J11 木卫四十六 Carpo S/2003 J3 S/2003 J12 木卫三十四 Euporie S/2003 J18 木卫三十五 Orthosie 木卫三十三 Euanthe 木卫二十九 Thyone S/2003 J16 木卫四十 Mneme 木卫二十二 Harpalyke 木卫三十 Hermippe 木卫二十七 Praxidike 木卫四十二 Thelxinoe 木卫四十五 Helike 木卫二十四 Iocaste 木卫十二 Ananke S/2003 J15 S/2003 J17 S/2003 J9 S/2003 J19 木卫三十二 Eurydome 木卫四十三 Arche 木卫二十八 Autonoe 木卫三十八 Pasithee 木卫二十一 Chaldene 木卫三十七 Kale 木卫二十六 Isonoe 木卫三十一 Aitne S/2003 J4 木卫二十五 Erinome 木卫二十 Taygete 木卫十一 Carme 木卫三十六 Sponde 木卫二十三 Kalyke 木卫八 Pasiphae 木卫四十七 Eukelade 木卫十九 Megaclite 木卫九 Sinope 木卫三十九 Hegemone 木卫四十一 Aoede 木卫四十四 Kallichore S/2003 J23 S/2003 J5 木卫十七 Callirrhoe　　 S/2003 J10 木卫四十八 Cyllene S/2003 J14 S/2003 J2

参考: earthfgtpedu/learn/solar/jupiter

分子进化的研究对象是核酸和蛋白质序列。研究某个基因的进化，是用它的DNA序列，还是翻译后的蛋白质序列呢？序列的选取要遵循以下原则：1）如果DNA序列的两两间的一致度≥70%，选用DNA序列。因为，如果DNA序列都如此相似，它的蛋白质会相似到看不出区别，这对构建系统发生树是不利的。所以这种情况下应该选用DNA序列，而不选蛋白质序列。2）如果DNA序列的两两间的一致度≤70%，DNA序列和蛋白质序列都可以选用。

将要用于构建系统进化树的所有序列合并到同一个fasta格式文件，注意：所有序列的方向都要保持一致 ( 5’-3’)。 想要做系统发生树先要做多序列比对，然后把多序列比对的结果提交给建树软件进行建树，所以在用MEGA建树时可以输入一个已经比对好的多序列比对，也可以输入一条原始序列，让MEGA先来做多序列比对，再建树（一般我们都是原始序列）。所以我们以后者为例。

打开MEGA软件，选择主窗口的”File” → “Open A File”→找到并打开fasta文件，这时会询问以何种方式打开，我们是原始序列，需要先进行多序列比对，所以选择“Align”。如果是比对好的多序列比对可以直接选择“Analyze”。

在打开的Alignment Explorer窗口中选择”Alignment”“Align by -ClustalW” 进行多序列比对（MEGA提供了ClustalW和Muscle两种多序列比对方法，这里选择熟悉的ClustalW），弹出窗口询问“Nothing selected for alignment，Select all？”选择“OK”。

之后，弹出多序列比对参数设置窗口。这个窗口和EMBL在线多序列比对一样，可以设置替换记分矩阵、不同的空位罚分（罚分填写的是正数，计算时按负数计算）等参数。MEGA的所有默认参数都是经过反复考量设置的，这保证了MEGA傻瓜机全自动档的品质，所以当你无从下手，或者没有什么特别要求的时候，直接点击“OK”，接受这些默认参数，开始多序列比对。

了解两个参数：

① 替换记分矩阵，替换记分矩阵是反映残基之间相互替换率的矩阵，也就是说，它描述了残基两两相似的量化关系。DNA 序列有 DNA 序列的替换记分矩阵，蛋白质序列有蛋白质序列的替换记分矩阵，两者不可混用。

DNA 序列的替换记分矩阵主要有三种：1）等价矩阵。相同核苷酸得分为 1，不同核苷酸间的替换得分为 0。由于不含碱基的理化信息和不区别对待不同的替换，一般只用于理论计算。 2）转换-颠换矩阵。转换：DNA分子中的嘌呤被嘌呤或嘧啶被嘧啶替换。颠换：DNA分子中的嘌呤被嘧啶或嘧啶被嘌呤替换。在进化过程中，转换发生的频率远比颠换高。为了反映这一情况，转换-颠换矩阵中，转换的得分比颠换要高为-1 分，而颠换的得分为-5 分。 3）BLAST 矩阵。经过大量实际比对发现，如果令被比对的两个核苷酸相同时得分为+5 分，不相同为-4 分，这时比对效果最好。这个矩阵广泛地被 DNA 序列比较所采用。没有为什么，就是好，实践经验所得。因为这个矩阵最早应用于 BLAST 工具，因此得名 BLAST 矩阵。

蛋白质的替换记分矩阵要比核酸的复杂一些： 1）等价矩阵。相同得 1 分，不同得 0 分。 2）PAM矩阵。基础的 PAM-1矩阵反应的是进化产生的每一百个氨基酸平均发生一个突变的量值，是基于相似度＞85%的序列产由统计方法计算得到的。由PAM-1 自乘 n 次可以外推得到 PAM-n ，表示发生了更多次突变。如果序列亲缘关系远，也就是说序列间会有很多突变，那就选 PAM 后面跟一个大数字的矩阵；如果亲缘关系近，也就是突变比较少，序列间大多数地方都是一样的，那就选 PAM 后面跟一个小数字的矩阵。3）BLOSUM矩阵。后面也有一个编号，是通过对大量符合特定要求的序列计算而来的。比如BLOSUM62是指这个矩阵是由一致度≥62%的序列计算得到的。如果序列亲缘关系远，序列相似度低，那就选BLOSUM 后面跟一个小数字的矩阵；如果序列亲缘关系近，序列相似度高，那就选BLOSUM 后面跟一个大数字的矩阵。总结，亲缘关系较近的序列之间的比较，用 PAM 数小的矩阵或BLOSUM 数大的矩阵；而亲缘关系较远的序列之间的比较，用 PAM 数大的矩阵或 BLOSUM数小的矩阵。对于关系较远的序列之间的比较，由于 PAM250 是通过矩阵自乘推算而来的，所以其准确度受到一定限制。相比之下BLOSUM 矩阵更具优势。对于关系较近的序列之间的比较，用 PAM 或 BLOSUM 矩阵做出的比对结果，差别不大。如果关于要比较的序列不知道亲缘关系远近，那么就闭着眼睛用BLOSUM62 吧！如果你记

不住或者听不懂上面讲的种种，那就记住 BLOSUM62 这个名字，也可以走遍天下全不怕！

图1：氨基酸差异与矩阵编号对照

图2: 序列亲缘关系远近与矩阵的选择 ② 空位罚分包括两种： gap 开头（gap open）和gap延长（gap

extend）。默认gap开头罚分高，gap延长罚分低，这样得出的结果gap很集中，有很多长串出现的gap，这可以比对两条很相似的序列–同源序列；相反，如果gap开头罚分少，gap延长罚分高，比对结果gap就比较分散，极少出现连续长串的gap（可以想象其中的原因，总是要保证得分高），这可以比对两条绝大部分序列都很相似，但其中一条的一个功能区在另一条序列中是缺失的两条序列，可以找出这个功能区。

比对过程是先进行双序列比对，在进行多序列比对，最后会出现一个多序列比对结果。将之作为中间结果保存下来。在Alignment Explorer窗口中选择“Data”→“Export Alignment”→“MEGA Format”。这里一定选择MEGA format以方便MEGA后续分析（其他格式适用于其他软件的分析），MEGA自动赋予“meg”后缀名，保存后，

弹出窗口，“为这组数据命名”，自己看得懂知道就可以，我这里命名为“il1r2 alignment”。

生成的“meg”文件可以双击直接导入MEGA。也可以将其拖入MEGA主窗口中。拖入后主窗口增加了一个“TA”按钮，点击弹出新窗口“Sequence Data Explorer”，其是多序列比对结果。再点击“Sequence Data Explorer”上的“TA”按钮，点击后多序列最上面增加了一行，这一行是根据多序列比对结果分析得出的共有序列（consensus sequence），也就是一列里出现次数最多的字母。多序列比对中每一列里的字母如果和共有序列相同则打点，不同则标出不同的字母，空位还是空位。

如果还想进一步了解序列的保守程度，可以点击“C”按钮 ，以**标记保守序列；或者点击“V”按钮 ，以**标记不保守序列。通过进一步的分析，可以淘汰掉一些序列，比如海选的的序列里有一些不合群的序列，就可以把他们去掉，不让他们参与建树，以免影响建树质量。

此外，还可以对这些序列进行分组标记。点击分组按钮，点击“加号”按钮，更改组名，然后按住Ctrl键同时选中Ungrouped Taxa 列表中的要放入这个组的序列，选中后点击“箭头”按钮，即可将序列放入分组。同理，可以创建其他分组。当序列数量较多时，人为分组，可以从树上更加清晰的看出组内哪些成员叛逃了去了别的组。

此外，输入序列的名字较长，作为构建的系统发生树上叶子的名字，会破坏树的外观也不利于信息的解读。因此，需要人为修改一下序列的名字。选中序列后点击，把名字改为能区分彼此的关键词，全部改好之后点击“save”按钮，准备工作全部完成。

开始建树。点击MEGA主窗口上的Phylogeny下拉菜单，选择Neighbor Joining（最近邻居法）。弹出窗口询问是否使用当前 meg里面的数据，选Yes。接下来，弹出参数设置窗口（Analysis Preferences）。参数设置对构建的系统发生树的准确程度非常重要。在树构建好之后，还经常需要根据树的具体情况，重新设置参数，并重新建树，如此反复，纸质结果令人满意为止。同样的如果对参数设置摸不着头脑，就接受默认设置，也能做出基本满意的系统发生树。 至少应该掌握其中三个参数的设置： ① Test of Phylogeny（建树的检验方法），是用来检验建树的质量的。默认的检验方法是Bootstrp method （步长检验）。步长检验需要设

定检验次数，通常为100的倍数，默认设置为500。步长检验是根据所选择的建树方法，计算并绘制指定次数株系统发生树。因为大多数建树的方法的核心算法都是统计概率模型，所以每次计算出来的树都会有所差别。而剑豪的系统发生树上每个节点上都会标有一个数字，它代表了指定次数次计算所得出的系统发生树中有百分之多少的树都含有这一节点。一般来讲，绝大多数节点上的数值都大于70%的树才可信。个别低于70%的节点可以暂且容忍，或通过添加、山间序列来改善质量。

② Substitution Model。是选择计算遗传距离时使用的计算模型。理论上应该尝试各种模型，根据检验结果选择最合适的模型计算。但在实际操作中，可先尝试选用较简单的距离模型，比如p-distance。 ③ Gap/Missing Data Treatment，大多数建树方法会要求删除多序列比对中含有空位较多的列。但是根据遗传距离度量方法的不同，删除原则也不同。如果是以序列间不同残基的个数来度量遗传距离的话，这里需要选择 Complete deletion（全部删除）。如果是其他方 法，比如这里选用的 NJ 方法，可以选择 Partial deletion（部分删除）。删除程度定在 50%，即，保留一半含有空位的列。

按照以上方案参数设置后，点击“Compute”按钮 ，开始构建系统发生树。经过一番计算之后，新窗口 Tree Explorer 里展示的就是创建好的系统发生树。这个窗口里有两个标签页。第一个是 Original Tree（原始树），第二个是 Bootstrap consensus tree（步长检验合并出来的树）。Bootstrap consensus tree 上，节点处的数字表示，经步长检验有百分之几的树具有这根树枝，即，反应了该树枝的可信度。当前构建的这株系统发生树中，绝大多数节点处的数值都是≥70 的话，这株树整体上就是可信的 。

Original Tree 是步长检验构建的 500 株树中的一株，未经过多棵树合并，所以树枝的长短可以精确代表遗传距离。此外，从这株树也可以看出之前的人为分组情况是不是发生了意想不到的变化。比如，有的可能似乎脱离了分组，成为了外类群，从而确定了树根。 树构建好之后，外形也许还不太令人满意。比如也许你想要将树的外形改成圆形或三角型，可以通过 按钮选择。或者你想要调整树枝的粗细或字体的大小，可以从 View 下拉菜单下的 Option 选项卡中调整。调整好之后，就可以把这棵树保存成了。保存可以点Image 下拉菜单，选择保存格式。或者将窗口放大，再点按钮将树放大之后屏幕截图。

使用TreeExplorer窗口中提供的一些功能可以对生成的系统进化树进行调整和美化。另外，还可以用Word进一步编辑MEGA构建的进化树。

至此，一株 NJ 树就构建好了。

一般说来，MEGA适用于对少量的序列进行比对和画Tree，如需处理大量或海量的序列数据，建议使用ARB。