是的,胶的厚度对电泳效果也有一定影响。如果胶的厚度太厚,会导致电泳过程中的电阻增大,从而影响到电泳的速度和分离效果。因此,在制作胶板时,需要控制好胶的厚度,以确保电泳的效率和分离效果。
同时,还有其他因素也可能影响电泳的效果,如缓冲液的浓度、成分、pH值等。因此,在进行电泳实验时,需要根据具体情况选择合适的条件,以获得最佳的实验效果。
OD值很好只能代表你的纯度高并不能代表你提的完整。所以RNA降解可能是你提的时候就降解了,也可能是跑胶的时候降解的。假设你提取的是完整的RNA,可能出问题的步骤有以下:1loading buffer ,确定是使用的RNA 专用的,且使用步骤是按说明书来的(有些是需要加热,冷却等步骤)
2电泳时间长,需用的电泳电压不恰当
3电泳液配置,电泳液中可能含RNA酶,将你的样品降解。
总之,降解可能是很多原因造成的,我没看到你的电泳图,也不知道你怎么提取得,不好确定到底是什么原因,你可以加我恰QQ272228132,可以讨论下。
提取完了用分光光度计能够测定浓度,跑胶主要看两个条带(18s,28s)都在,弥散多不多,从而判断RNA分子完整性。
http://wwwlabbasenet/News/ShowNewsDetails-2-11-0716260834924DD8html
核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)是组成核糖体的主要成分。核糖体是合成蛋白质的工厂。在大肠杆菌中,rRNA量占细胞总RNA量的75%-85%,而tRNA占15%,mRNA仅占3-5%。
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起,形成核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数(sedimentation coefficient),当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时,此速度与粒子的大小直径成比例。5S含有120个核苷酸,16S含有1540个核苷酸,而23S含有2900个核苷酸。而真核生物有4种rRNA,它们分子大小分别是5S、58S、18S和28S,分别具有大约120、160、 1900和4700个核苷酸。
RNA样品电泳后,可见28S、18S及5S小分子RNA条带,则说明完整性好。若有降解可能是操作不当或污染了RNase。28S和18S RNA比值约为2:1,表明RNA无降解。如比值逆转,则表明RNA降解。
透气型塑胶跑道底层材料为:胶水、黑颗粒,胶水由聚醚和环保型MDI混合做成预聚体;红、黑颗粒为环保材料在特制的平台上制成胶片,经过切割,打碎,筛选出粒径为3~5mm的黑颗粒作为打底专用标准型颗粒,筛选出15mm左右的红、绿颗粒面层
博凌科为-为你解答:1模板可能有降解,建议避免反复冻融,放置时间不能太长。模板的质量是最重要的。2抽提RNA时有污染,包括基因组DNA污染和蛋白质污染,需重 做抽提。3提高退火温度,减少非特异性扩增。4减少循环次数,减少非特异性扩增。5电泳缓冲液时间太长,ph值和盐离子浓度明显 改变。6电泳时电压不能太高,8V/cm。7一般来讲,基于promega和TaKaRa的PCR反应体系中,Mg和dNTP的浓度是相 匹配的,不需改动。8 加样量过大。过多的量会造成加样孔超载,从而导致拖尾和弥散,对于较大的DNA此现象更明显。9制胶过程中胶孔没 制好。10 EB没有冲洗干净。11模板混有基因组DNA,或模板中混有蛋白。12非特异反映。引物设计的不好,非特异,这种情 况容易出现非特异扩增造成有非特异性扩增带或拖尾现象。13电泳液用久了不换,电泳胶脏了 。14扩增的条件不合适,一般退火温度低时容 易使引物在非特异位置结合引发扩增反应造成拖尾。针对以上情况,可以先提高退火温度试试,如果实在不行,再看看引物是不是合适。如果 内参可以扩出来,只能说明程序可能是适合的,但不能完全说明体系合适。体系内的各组分,如模板、dNTP、Mg离子、引物等都可能造成拖尾。先得考虑换了 那种成分后出现了拖尾,逐项试验。引物当然是最重要的因素,但绝非造成拖尾的唯一原因。而且,一般而言,拖尾不会是引物的问题,尤其是已经被用过证明能扩 出特异片段的 引物,更不可能是它的问题了。先不要加Taq酶,等到其他东西都加完了以后,放到PCR仪上去,到那时再加,马上开启PCR程序试试。检 查一下你的dNTP的量够不够。适当减少2~3个循环试试,可能会有效果。
三条是主带
哺乳动物的RNA包括mRNA,rRNA,tRNA和小RNA,根据分子量和沉降系数的不同,rRNA又可分为28s, 18s 和5s 的rRNA。从RNA的含量上看,rRNA是几种RNA中最多的,高达90%以上,而mRNA很少,只有1-2%,而其他两种RNA的分子量比较小,这就解释了为什么从凝胶电泳的结果上只能看到三条带。而这三条带的完整性,就代表了mRNA的完整性,也就是说如果我们观察到这三条带是清新完整,就说明我们提取到的RNA质量比较好,反之,如果观察到这三条带成弥散状,就说明我们提取到的RNA比较不好。
核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)是组成核糖体的主要成分。核糖体是合成蛋白质的工厂。在大肠杆菌中,rRNA量占细胞总RNA量的75%-85%,而tRNA占15%,mRNA仅占3-5%。
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起,形成核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。
原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数(sedimentation coefficient),当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时,此速度与粒子的大小直径成比例。5S含有120个核苷酸,16S含有1540个核苷酸,而23S含有2900个核苷酸。而真核生物有4种rRNA,它们分子大小分别是5S、58S、18S和28S,分别具有大约120、160、 1900和4700个核苷酸。
RNA样品电泳后,可见28S、18S及5S小分子RNA条带,则说明完整性好。若有降解可能是操作不当或污染了RNase。28S和18S RNA比值约为2:1,表明RNA无降解。如比值逆转,则表明RNA降解。
应该从下到上:5s、18s、28s、
120、1900、4700bp、
提取的总RNA跑胶从大到小有带3条,
5S,18S,28S。 5S应该最暗,28S应该最亮。和DNA Marker比较的话,28S大概在5K左右,18S大概在3K左右,58S和5S是用琼脂糖是分开不了的,只是一条很弱的条带,在100BP左右,好的RNA要求28S亮度是18S的两倍。
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